27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_0231 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009637  MmarC7_0231  hypothetical protein  100 
 
 
254 aa  523  1e-147  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1669  hypothetical protein  94.86 
 
 
254 aa  497  1e-140  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.987983  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0809  hypothetical protein  93.7 
 
 
254 aa  496  1e-139  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0316  hypothetical protein  79.53 
 
 
254 aa  424  1e-118  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0733  hypothetical protein  54.2 
 
 
267 aa  306  1.0000000000000001e-82  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00487772  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1941  hypothetical protein  28.16 
 
 
479 aa  112  5e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000577788  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0387  hypothetical protein  31.73 
 
 
258 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.776288 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0661  hypothetical protein  29.39 
 
 
442 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000499977  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2181  hypothetical protein  31.25 
 
 
306 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.175616 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0408  hypothetical protein  29.02 
 
 
441 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0227  Protein of unknown function DUF516  35.44 
 
 
273 aa  107  1e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.420083  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0054  Protein of unknown function DUF516  33.18 
 
 
238 aa  103  2e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0283934  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2266  hypothetical protein  28.03 
 
 
458 aa  103  3e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.000000113487  normal  0.0819386 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0158  hypothetical protein  27.78 
 
 
435 aa  102  9e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.418536 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0773  hypothetical protein  31.12 
 
 
269 aa  100  2e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1586  hypothetical protein  29.53 
 
 
443 aa  99.4  5e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.0000000507896  hitchhiker  0.00416523 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1372  Protein of unknown function DUF516  31.03 
 
 
444 aa  98.2  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2476  hypothetical protein  29.09 
 
 
450 aa  95.9  6e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0902  hypothetical protein  29.02 
 
 
493 aa  86.3  4e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.757817  normal  0.396557 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2934  Protein of unknown function DUF516  28.34 
 
 
453 aa  85.9  6e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0227101  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0095  hypothetical protein  27.84 
 
 
267 aa  84.7  0.000000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.342459  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0774  hypothetical protein  25.79 
 
 
237 aa  84.3  0.000000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.515011  normal  0.0296069 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2781  Protein of unknown function DUF516  25.99 
 
 
486 aa  84.3  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1544  hypothetical protein  27.49 
 
 
252 aa  74.7  0.000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0140701 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1476  hypothetical protein  24.75 
 
 
252 aa  68.2  0.0000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0640  hypothetical protein  27.44 
 
 
252 aa  66.6  0.0000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.000906628  hitchhiker  0.000483449 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1672  hypothetical protein  25.3 
 
 
251 aa  62.8  0.000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000720356 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>