27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0387 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_0387  hypothetical protein  100 
 
 
258 aa  536  1e-151  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.776288 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0227  Protein of unknown function DUF516  29.52 
 
 
273 aa  121  9e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.420083  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2181  hypothetical protein  31.33 
 
 
306 aa  120  3e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.175616 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0809  hypothetical protein  30.92 
 
 
254 aa  116  3e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1941  hypothetical protein  29.2 
 
 
479 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000577788  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1669  hypothetical protein  32.84 
 
 
254 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.987983  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0231  hypothetical protein  31.73 
 
 
254 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1586  hypothetical protein  30.99 
 
 
443 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.0000000507896  hitchhiker  0.00416523 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2476  hypothetical protein  31.07 
 
 
450 aa  107  2e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0661  hypothetical protein  32.29 
 
 
442 aa  107  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000499977  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0316  hypothetical protein  29.12 
 
 
254 aa  106  3e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2781  Protein of unknown function DUF516  35.22 
 
 
486 aa  106  3e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0733  hypothetical protein  31.47 
 
 
267 aa  105  5e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00487772  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1372  Protein of unknown function DUF516  35.03 
 
 
444 aa  104  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2266  hypothetical protein  30.25 
 
 
458 aa  103  2e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.000000113487  normal  0.0819386 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0408  hypothetical protein  32.56 
 
 
441 aa  100  3e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0902  hypothetical protein  33.33 
 
 
493 aa  99.8  4e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.757817  normal  0.396557 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0158  hypothetical protein  31.46 
 
 
435 aa  92.8  5e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.418536 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2934  Protein of unknown function DUF516  32.28 
 
 
453 aa  91.3  1e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0227101  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0095  hypothetical protein  29.86 
 
 
267 aa  90.1  4e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.342459  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0054  Protein of unknown function DUF516  33.13 
 
 
238 aa  88.2  1e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0283934  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0773  hypothetical protein  30.3 
 
 
269 aa  86.3  5e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0640  hypothetical protein  25.1 
 
 
252 aa  85.5  8e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.000906628  hitchhiker  0.000483449 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0774  hypothetical protein  27.78 
 
 
237 aa  75.1  0.000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.515011  normal  0.0296069 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1476  hypothetical protein  23.12 
 
 
252 aa  74.7  0.000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1544  hypothetical protein  24.37 
 
 
252 aa  65.9  0.0000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0140701 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1672  hypothetical protein  22.96 
 
 
251 aa  62.8  0.000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000720356 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>