38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1586 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_1586  hypothetical protein  100 
 
 		 443 aa  907    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.0000000507896  hitchhiker  0.00416523 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0408  hypothetical protein  40.27 
 
 		 441 aa  333  5e-90  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2266  hypothetical protein  42.57 
 
 		 458 aa  314  1.9999999999999998e-84  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.000000113487  normal  0.0819386 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0158  hypothetical protein  39.95 
 
 		 435 aa  310  4e-83  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.418536 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0661  hypothetical protein  37.47 
 
 		 442 aa  272  1e-71  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000499977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1941  hypothetical protein  29.58 
 
 		 479 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000577788  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2476  hypothetical protein  30.57 
 
 		 450 aa  153  5.9999999999999996e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1372  Protein of unknown function DUF516  29.89 
 
 		 444 aa  145  1e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2781  Protein of unknown function DUF516  29.85 
 
 		 486 aa  143  5e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2181  hypothetical protein  36.27 
 
 		 306 aa  141  3e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.175616 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0227  Protein of unknown function DUF516  33.94 
 
 		 273 aa  136  6.0000000000000005e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.420083  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2934  Protein of unknown function DUF516  30.52 
 
 		 453 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0227101  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0902  hypothetical protein  28.93 
 
 		 493 aa  121  3e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.757817  normal  0.396557 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0387  hypothetical protein  30.99 
 
 		 258 aa  109  9.000000000000001e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.776288 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0733  hypothetical protein  30.74 
 
 		 267 aa  103  4e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00487772  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1669  hypothetical protein  30.36 
 
 		 254 aa  103  6e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.987983  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0095  hypothetical protein  31.02 
 
 		 267 aa  100  6e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.342459  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0231  hypothetical protein  29.53 
 
 		 254 aa  99.4  1e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0316  hypothetical protein  30.65 
 
 		 254 aa  98.6  2e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0809  hypothetical protein  29.15 
 
 		 254 aa  97.8  3e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0054  Protein of unknown function DUF516  29.57 
 
 		 238 aa  80.9  0.00000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0283934  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0773  hypothetical protein  39.09 
 
 		 269 aa  72.8  0.00000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0774  hypothetical protein  26.35 
 
 		 237 aa  72  0.00000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.515011  normal  0.0296069 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0640  hypothetical protein  29.47 
 
 		 252 aa  70.5  0.00000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.000906628  hitchhiker  0.000483449 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1544  hypothetical protein  30.56 
 
 		 252 aa  67.4  0.0000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0140701 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1476  hypothetical protein  33.33 
 
 		 252 aa  56.6  0.0000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1672  hypothetical protein  31.15 
 
 		 251 aa  56.6  0.0000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000720356 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0429  ribonuclease Z  51.11 
 
 		 318 aa  52.8  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0430  ribonuclease Z  51.11 
 
 		 318 aa  51.6  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0401  ribonuclease Z  52.38 
 
 		 305 aa  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4523  ribonuclease Z  60 
 
 		 315 aa  47.4  0.0005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0967083  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4169  ribonuclease Z  51.11 
 
 		 314 aa  47  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.406356  normal  0.0568624 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5044  ribonuclease Z  62.86 
 
 		 320 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.574405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2503  ribonuclease Z  60 
 
 		 314 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.638997 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3611  ribonuclease Z  60 
 
 		 314 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0659  ribonuclease Z  71.43 
 
 		 309 aa  45.8  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.089983  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1475  beta-lactamase superfamily hydrolase  69.23 
 
 		 318 aa  45.1  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2011  ribonuclease Z  57.14 
 
 		 393 aa  43.1  0.009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>