12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0393 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0393  hypothetical protein  100 
 
 		 360 aa  721    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.628295  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0143  hypothetical protein  58.74 
 
 		 359 aa  421  1e-116  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.467996  decreased coverage  0.00277637 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2287  hypothetical protein  59.77 
 
 		 365 aa  392  1e-108  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1462  hypothetical protein  51.42 
 
 		 356 aa  363  2e-99  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1429  ABC-type transport system permease protein 2  35.56 
 
 		 351 aa  161  2e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0423537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2707  hypothetical protein  37.04 
 
 		 349 aa  156  6e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.44272  normal  0.031645 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2982  ABC-type transport system permease protein 2  34.71 
 
 		 361 aa  143  5e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1548  ABC-type Na+ efflux pump permease component- like protein  34.95 
 
 		 393 aa  135  1.9999999999999998e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3782  ABC-2 type transporter  25.36 
 
 		 378 aa  47  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02800  ABC transporter sodium permease  24.34 
 
 		 397 aa  46.2  0.0008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1445  ABC transporter sodium permease  27.85 
 
 		 394 aa  43.5  0.006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.757965  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1500  ABC transporter sodium permease  27.85 
 
 		 394 aa  43.1  0.007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.809114  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>