12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1429 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1429  ABC-type transport system permease protein 2  100 
 
 		 351 aa  675    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0423537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2707  hypothetical protein  50.31 
 
 		 349 aa  255  9e-67  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.44272  normal  0.031645 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2982  ABC-type transport system permease protein 2  50.16 
 
 		 361 aa  254  1.0000000000000001e-66  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1548  ABC-type Na+ efflux pump permease component- like protein  47.34 
 
 		 393 aa  204  2e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0143  hypothetical protein  37.06 
 
 		 359 aa  181  2e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.467996  decreased coverage  0.00277637 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1462  hypothetical protein  35.31 
 
 		 356 aa  179  8e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0393  hypothetical protein  35.56 
 
 		 360 aa  155  1e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.628295  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2287  hypothetical protein  35.69 
 
 		 365 aa  141  1.9999999999999998e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1379  ABC-2 type transporter  32.08 
 
 		 370 aa  49.3  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.463817  hitchhiker  0.000000727606 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2367  hypothetical protein  25.18 
 
 		 370 aa  46.2  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.175245  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00580  ABC-2 type transport system permease protein  29.71 
 
 		 369 aa  44.7  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0449353  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2514  ABC-2 type transporter  33.94 
 
 		 374 aa  42.7  0.009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.936785  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>