14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_2287 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_2287  hypothetical protein  100 
 
 		 365 aa  723    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0143  hypothetical protein  57.46 
 
 		 359 aa  429  1e-119  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.467996  decreased coverage  0.00277637 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0393  hypothetical protein  59.77 
 
 		 360 aa  410  1e-113  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.628295  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1462  hypothetical protein  49.15 
 
 		 356 aa  347  2e-94  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1429  ABC-type transport system permease protein 2  36.39 
 
 		 351 aa  157  3e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0423537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2707  hypothetical protein  34.89 
 
 		 349 aa  140  3e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.44272  normal  0.031645 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2982  ABC-type transport system permease protein 2  33.43 
 
 		 361 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1548  ABC-type Na+ efflux pump permease component- like protein  35.44 
 
 		 393 aa  118  9.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0341  ABC-2 type transporter  24.25 
 
 		 394 aa  53.5  0.000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0364  ABC-2 type transporter  24.16 
 
 		 394 aa  51.6  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2950  ABC-type Na+ efflux pump, permease component  24.75 
 
 		 397 aa  49.7  0.00008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.404593  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3577  transport protein, putative  25.32 
 
 		 378 aa  46.6  0.0007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4192  ABC-2 type transporter  25.82 
 
 		 381 aa  45.8  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.148286  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03077  putative ABC-type Na+ efflux pump, permease component  24.63 
 
 		 398 aa  45.8  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>