35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_5584 on replicon NC_011758
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_3978  transposase IS4 family protein  87.27 
 
 		 1344 bp  1253    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.846338 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3975  transposase IS4 family protein  87.27 
 
 		 1344 bp  1253    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.35264 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3973  transposase IS4 family protein  87.27 
 
 		 1344 bp  1253    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.667634 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3757  transposase IS4 family protein  87.27 
 
 		 1344 bp  1253    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00995603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3754  transposase IS4 family protein  87.27 
 
 		 1344 bp  1253    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.3144  normal  0.951777 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3737  transposase IS4 family protein  87.27 
 
 		 1344 bp  1253    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3687  transposase IS4 family protein  87.27 
 
 		 1344 bp  1253    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3026  transposase IS4 family protein  87.27 
 
 		 1344 bp  1253    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  hitchhiker  0.00816022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2473  transposase IS4 family protein  87.27 
 
 		 1344 bp  1253    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0307213  normal  0.0396002 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0102  transposase IS4 family protein  87.27 
 
 		 1344 bp  1253    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.849001 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4167  transposase IS4 family protein  87.27 
 
 		 1344 bp  1253    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4233  transposase IS4 family protein  87.27 
 
 		 1344 bp  1253    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4247  transposase IS4 family protein  87.27 
 
 		 1344 bp  1253    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.861289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4251  transposase IS4 family protein  87.27 
 
 		 1344 bp  1253    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4643  transposase IS4 family protein  87.27 
 
 		 1344 bp  1253    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5583    100 
 
 		 2237 bp  2666    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.488444  normal  0.111493 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5584    100 
 
 		 1345 bp  2666    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.514894  normal  0.125621 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5631    99.93 
 
 		 1345 bp  2658    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.808687  normal  0.480828 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7895    81.26 
 
 		 1078 bp  498  9.999999999999999e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.559963  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7794  transposase IS4 family protein  81.04 
 
 		 726 bp  295  2e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4308  transposase, IS4  82.59 
 
 		 1344 bp  149  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.661082  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7793    81.15 
 
 		 321 bp  127  9e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.830841  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2424  transposase, IS4  82.82 
 
 		 1344 bp  101  5e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1626  transposase, IS4  82.82 
 
 		 1344 bp  101  5e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.982067  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4590    82.82 
 
 		 1402 bp  101  5e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0443012  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5077  hypothetical protein  90.62 
 
 		 534 bp  79.8  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.23249  normal  0.479185 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2227  transposase, IS4 family protein  89.8 
 
 		 1347 bp  58  0.000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3502  transposase, IS4 family protein  89.8 
 
 		 1347 bp  58  0.000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3389  hypothetical protein  89.8 
 
 		 597 bp  58  0.000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.699751  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2072  hypothetical protein  100 
 
 		 237 bp  50.1  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.548888  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4458  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components-like protein  100 
 
 		 2610 bp  48.1  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.844292 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4972  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components-like protein  100 
 
 		 2604 bp  48.1  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0604795 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1417  peptidase S16 lon domain protein  93.75 
 
 		 2460 bp  48.1  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.185581  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4922  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components-like protein  100 
 
 		 2604 bp  48.1  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.125562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0571  outer membrane autotransporter barrel domain protein  96.43 
 
 		 1914 bp  48.1  0.007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0405147 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>