17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3334 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3334  hypothetical protein  100 
 
 
168 aa  333  7.999999999999999e-91  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129263  normal  0.0637905 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0477  hypothetical protein  52.59 
 
 
144 aa  102  2e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.446082  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1553  hypothetical protein  35.21 
 
 
145 aa  72  0.000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000880157 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3411  hypothetical protein  30 
 
 
158 aa  66.2  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0789  hypothetical protein  30.89 
 
 
169 aa  64.7  0.0000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.802988 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0408  Protein of unknown function DUF2495  38.83 
 
 
140 aa  62.8  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.991858  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1100  hypothetical protein  28.95 
 
 
145 aa  62  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0426  hypothetical protein  30.7 
 
 
145 aa  58.5  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00311673  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0448  hypothetical protein  29.82 
 
 
145 aa  58.5  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0328  hypothetical protein  30.5 
 
 
141 aa  56.2  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1519  hypothetical protein  27.1 
 
 
145 aa  55.1  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0943  hypothetical protein  38.75 
 
 
156 aa  52  0.000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.367982  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2700  hypothetical protein  24.27 
 
 
145 aa  50.8  0.000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2713  hypothetical protein  41.67 
 
 
161 aa  47.8  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000196179 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3115  hypothetical protein  41.67 
 
 
161 aa  47.8  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3605  hypothetical protein  32 
 
 
165 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2509  hypothetical protein  31 
 
 
165 aa  42.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000566175  normal  0.406315 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>