11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0448 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_0448  hypothetical protein  100 
 
 		 145 aa  284  2e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0426  hypothetical protein  95.86 
 
 		 145 aa  278  1e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00311673  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1100  hypothetical protein  66.21 
 
 		 145 aa  198  1.9999999999999998e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1519  hypothetical protein  68.28 
 
 		 145 aa  182  9e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2700  hypothetical protein  64.14 
 
 		 145 aa  174  4e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3334  hypothetical protein  29.82 
 
 		 168 aa  58.5  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129263  normal  0.0637905 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3411  hypothetical protein  29.01 
 
 		 158 aa  57.4  0.00000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0432  hypothetical protein  32.94 
 
 		 146 aa  52  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0477  hypothetical protein  27.68 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.446082  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0789  hypothetical protein  27.1 
 
 		 169 aa  43.5  0.0008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.802988 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1553  hypothetical protein  21.74 
 
 		 145 aa  40.4  0.008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000880157 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>