24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0789 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0789  hypothetical protein  100 
 
 		 169 aa  328  3e-89  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.802988 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1553  hypothetical protein  39.86 
 
 		 145 aa  104  6e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000880157 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0408  Protein of unknown function DUF2495  43.38 
 
 		 140 aa  97.1  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.991858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3411  hypothetical protein  35.61 
 
 		 158 aa  80.1  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3334  hypothetical protein  30 
 
 		 168 aa  72  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129263  normal  0.0637905 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1100  hypothetical protein  33.85 
 
 		 145 aa  64.3  0.0000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0448  hypothetical protein  26.87 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3115  hypothetical protein  52 
 
 		 161 aa  55.8  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2713  hypothetical protein  52 
 
 		 161 aa  55.8  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000196179 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0426  hypothetical protein  26.87 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00311673  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3605  hypothetical protein  32.28 
 
 		 165 aa  54.7  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2509  hypothetical protein  32.28 
 
 		 165 aa  54.3  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000566175  normal  0.406315 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0477  hypothetical protein  28.45 
 
 		 144 aa  51.6  0.000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.446082  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0480  membrane protein-like protein  32.26 
 
 		 190 aa  50.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0943  hypothetical protein  35.29 
 
 		 156 aa  49.7  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.367982  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0328  hypothetical protein  28.74 
 
 		 141 aa  49.7  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2700  hypothetical protein  32.94 
 
 		 145 aa  47  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1370  hypothetical protein  34.07 
 
 		 165 aa  47.4  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0112209 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1519  hypothetical protein  31.52 
 
 		 145 aa  45.4  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3296  hypothetical protein  26.71 
 
 		 186 aa  45.1  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1858  hypothetical protein  33.33 
 
 		 182 aa  45.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1196  hypothetical protein  27.27 
 
 		 139 aa  45.1  0.0005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1896  hypothetical protein  32.93 
 
 		 146 aa  42.4  0.003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0600  hypothetical protein  24.73 
 
 		 168 aa  41.6  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.131981  normal  0.122017 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>