20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3411 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3411  hypothetical protein  100 
 
 		 158 aa  313  7e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0789  hypothetical protein  38.46 
 
 		 169 aa  82.4  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.802988 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1553  hypothetical protein  34.21 
 
 		 145 aa  73.2  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000880157 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3334  hypothetical protein  30.71 
 
 		 168 aa  72  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129263  normal  0.0637905 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0477  hypothetical protein  34.43 
 
 		 144 aa  63.2  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.446082  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0426  hypothetical protein  28.47 
 
 		 145 aa  60.1  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00311673  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0448  hypothetical protein  28.47 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2700  hypothetical protein  32.65 
 
 		 145 aa  58.2  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0408  Protein of unknown function DUF2495  31.86 
 
 		 140 aa  57.8  0.00000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.991858  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1100  hypothetical protein  30.53 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2713  hypothetical protein  45.12 
 
 		 161 aa  55.1  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000196179 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3115  hypothetical protein  45.12 
 
 		 161 aa  55.1  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0943  hypothetical protein  35.71 
 
 		 156 aa  52.4  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.367982  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1519  hypothetical protein  30.68 
 
 		 145 aa  50.8  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3605  hypothetical protein  36.17 
 
 		 165 aa  50.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2509  hypothetical protein  36.17 
 
 		 165 aa  50.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000566175  normal  0.406315 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0328  hypothetical protein  31.71 
 
 		 141 aa  47.8  0.00006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0480  membrane protein-like protein  38.1 
 
 		 190 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1370  hypothetical protein  39.22 
 
 		 165 aa  42  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0112209 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1858  hypothetical protein  39.22 
 
 		 182 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>