11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1100 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1100  hypothetical protein  100 
 
 		 145 aa  278  2e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2700  hypothetical protein  81.38 
 
 		 145 aa  214  4e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0426  hypothetical protein  67.59 
 
 		 145 aa  201  2e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00311673  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1519  hypothetical protein  76.55 
 
 		 145 aa  198  1.9999999999999998e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0448  hypothetical protein  66.21 
 
 		 145 aa  198  1.9999999999999998e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3334  hypothetical protein  28.95 
 
 		 168 aa  62  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129263  normal  0.0637905 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0432  hypothetical protein  27.42 
 
 		 146 aa  57.4  0.00000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3411  hypothetical protein  32.18 
 
 		 158 aa  54.7  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0789  hypothetical protein  33.65 
 
 		 169 aa  51.6  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.802988 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1553  hypothetical protein  27.13 
 
 		 145 aa  47.8  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000880157 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0477  hypothetical protein  26.87 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.446082  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>