17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3002 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3002  hypothetical protein  100 
 
 
234 aa  487  1e-137  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.407926  hitchhiker  0.0038842 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2092  hypothetical protein  53.67 
 
 
226 aa  255  4e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0736207  normal  0.350864 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0207  hypothetical protein  52.31 
 
 
240 aa  244  9e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.385068  hitchhiker  0.00420138 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0198  hypothetical protein  52.05 
 
 
223 aa  242  3.9999999999999997e-63  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3315  hypothetical protein  47.03 
 
 
228 aa  223  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3519  hypothetical protein  46.08 
 
 
223 aa  220  1.9999999999999999e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4000  SAM-dependent methyltransferase  48.88 
 
 
227 aa  219  3e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.021508 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3295  SAM-dependent methyltransferase  44.5 
 
 
231 aa  203  1e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.450794 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2858  hypothetical protein  39.91 
 
 
236 aa  169  4e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.271443 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1786  hypothetical protein  32.56 
 
 
228 aa  134  9.999999999999999e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1787  hypothetical protein  32.56 
 
 
228 aa  134  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1075  hypothetical cytosolic protein  33.49 
 
 
230 aa  126  3e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.969633  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0967  hypothetical protein  33.03 
 
 
230 aa  123  2e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1532  hypothetical protein  31.82 
 
 
264 aa  121  9.999999999999999e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.844774 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0224  hypothetical protein  30.4 
 
 
263 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.926328  normal  0.430302 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2033  hypothetical protein  31.67 
 
 
230 aa  94.7  1e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.848941  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2235  hypothetical protein  32.08 
 
 
249 aa  88.6  9e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0316491  normal  0.165482 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>