17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_0224 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_0224  hypothetical protein  100 
 
 
263 aa  544  1e-154  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.926328  normal  0.430302 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2033  hypothetical protein  40.74 
 
 
230 aa  160  2e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.848941  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1532  hypothetical protein  34.73 
 
 
264 aa  129  3e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.844774 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3315  hypothetical protein  33.47 
 
 
228 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4000  SAM-dependent methyltransferase  31.33 
 
 
227 aa  113  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.021508 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2092  hypothetical protein  33.47 
 
 
226 aa  107  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0736207  normal  0.350864 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0198  hypothetical protein  31.36 
 
 
223 aa  106  5e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3002  hypothetical protein  30.4 
 
 
234 aa  103  3e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.407926  hitchhiker  0.0038842 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2858  hypothetical protein  31.67 
 
 
236 aa  103  3e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.271443 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3519  hypothetical protein  32.04 
 
 
223 aa  100  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0207  hypothetical protein  29.8 
 
 
240 aa  96.7  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.385068  hitchhiker  0.00420138 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3295  SAM-dependent methyltransferase  27.85 
 
 
231 aa  96.7  4e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.450794 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1787  hypothetical protein  27.54 
 
 
228 aa  85.1  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1786  hypothetical protein  27.12 
 
 
228 aa  83.2  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2235  hypothetical protein  31.14 
 
 
249 aa  82  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0316491  normal  0.165482 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1075  hypothetical cytosolic protein  29.15 
 
 
230 aa  61.6  0.00000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.969633  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0967  hypothetical protein  28.7 
 
 
230 aa  59.3  0.00000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>