22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1532 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_1532  hypothetical protein  100 
 
 
264 aa  525  1e-148  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.844774 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0224  hypothetical protein  34.73 
 
 
263 aa  129  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.926328  normal  0.430302 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2092  hypothetical protein  33.88 
 
 
226 aa  128  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0736207  normal  0.350864 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2858  hypothetical protein  37.05 
 
 
236 aa  125  1e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.271443 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3002  hypothetical protein  31.82 
 
 
234 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.407926  hitchhiker  0.0038842 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3315  hypothetical protein  33.74 
 
 
228 aa  116  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0198  hypothetical protein  30.77 
 
 
223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0207  hypothetical protein  31.58 
 
 
240 aa  109  3e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.385068  hitchhiker  0.00420138 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3519  hypothetical protein  30.65 
 
 
223 aa  102  4e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2033  hypothetical protein  32.93 
 
 
230 aa  102  6e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.848941  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4000  SAM-dependent methyltransferase  29.39 
 
 
227 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.021508 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2235  hypothetical protein  48.08 
 
 
249 aa  90.1  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0316491  normal  0.165482 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3295  SAM-dependent methyltransferase  25.49 
 
 
231 aa  87  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.450794 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1787  hypothetical protein  27 
 
 
228 aa  77.8  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1786  hypothetical protein  28.36 
 
 
228 aa  75.5  0.0000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1075  hypothetical cytosolic protein  29.63 
 
 
230 aa  69.7  0.00000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.969633  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0967  hypothetical protein  29.17 
 
 
230 aa  65.5  0.0000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1104  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.78 
 
 
239 aa  45.1  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.580904  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3212  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.78 
 
 
239 aa  45.1  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.812098  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2800  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.83 
 
 
242 aa  42.4  0.008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.241472 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2296  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.83 
 
 
236 aa  42.4  0.009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1768  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.97 
 
 
241 aa  42  0.01  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.69336  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>