17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2235 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2235  hypothetical protein  100 
 
 		 249 aa  484  1e-136  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0316491  normal  0.165482 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3315  hypothetical protein  38.68 
 
 		 228 aa  132  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3002  hypothetical protein  34.91 
 
 		 234 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.407926  hitchhiker  0.0038842 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4000  SAM-dependent methyltransferase  33.02 
 
 		 227 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.021508 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3519  hypothetical protein  35.21 
 
 		 223 aa  113  3e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2092  hypothetical protein  35.68 
 
 		 226 aa  110  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0736207  normal  0.350864 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3295  SAM-dependent methyltransferase  34.42 
 
 		 231 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.450794 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1532  hypothetical protein  39.33 
 
 		 264 aa  109  3e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844774 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0224  hypothetical protein  33.33 
 
 		 263 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.926328  normal  0.430302 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0198  hypothetical protein  34.58 
 
 		 223 aa  109  4.0000000000000004e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0207  hypothetical protein  34.11 
 
 		 240 aa  108  7.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.385068  hitchhiker  0.00420138 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2858  hypothetical protein  37.5 
 
 		 236 aa  99  6e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.271443 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2033  hypothetical protein  32.88 
 
 		 230 aa  77.8  0.0000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.848941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1075  hypothetical cytosolic protein  30.59 
 
 		 230 aa  75.9  0.0000000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.969633  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0967  hypothetical protein  30.14 
 
 		 230 aa  72.4  0.000000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1787  hypothetical protein  32.16 
 
 		 228 aa  65.5  0.0000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1786  hypothetical protein  32.16 
 
 		 228 aa  64.7  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>