33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0167 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007633  MCAP_0167  hypothetical protein  100 
 
 
534 aa  1056    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.381097  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0274  hypothetical protein  35.11 
 
 
245 aa  82.4  0.00000000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.123346  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0425  hypothetical protein  31.21 
 
 
267 aa  67  0.0000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0439  hypothetical protein  31.21 
 
 
267 aa  67  0.0000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00568017  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3827  hypothetical protein  31.21 
 
 
267 aa  67  0.0000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.745457  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4120  hypothetical protein  31.21 
 
 
267 aa  67  0.0000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4023  hypothetical protein  31.16 
 
 
263 aa  65.9  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0806  AAA ATPase  25.86 
 
 
343 aa  65.5  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.337759  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02920  hypothetical protein  25.73 
 
 
188 aa  58.5  0.0000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.0000000406909  hitchhiker  2.4308e-42 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1499  IstB domain protein ATP-binding protein  30.67 
 
 
247 aa  57  0.0000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0674056  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0633  hypothetical protein  28.19 
 
 
311 aa  54.7  0.000005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0700177  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23130  AAA ATPase  26.92 
 
 
348 aa  54.3  0.000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2606  DNA replication protein-like protein  29.6 
 
 
211 aa  53.5  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000882358 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0041  hypothetical protein  24.57 
 
 
241 aa  52  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3449  AAA family ATPase  29.61 
 
 
276 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.539616  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5818  ATPase  26.45 
 
 
250 aa  52.4  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3454  AAA ATPase  29.61 
 
 
276 aa  52.4  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1416  primosomal protein DnaI  27.37 
 
 
299 aa  52  0.00003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0273394  hitchhiker  0.000000000000115155 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0538  Chromosomal replication initiator DnaA  26.09 
 
 
319 aa  51.6  0.00004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3534  hypothetical protein  29.05 
 
 
276 aa  49.7  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3818  hypothetical protein  29.05 
 
 
276 aa  49.7  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02457  putative transposase  25.42 
 
 
240 aa  47  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.367344  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2347  DNA replication protein DnaC  25.42 
 
 
327 aa  46.2  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.104478  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2418  DNA replication protein DnaC  23.93 
 
 
347 aa  46.6  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.132459  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0041  DNA replication protein DnaC  23.87 
 
 
337 aa  45.8  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0105  DNA replication protein DnaC  24.85 
 
 
334 aa  45.4  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03410  DNA replication protein  28.33 
 
 
257 aa  46.2  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.896278  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1255  putative replication protein DnaC  22.3 
 
 
276 aa  44.7  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0168344  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2623  DNA replication protein DnaC  29.61 
 
 
331 aa  44.3  0.006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0531  replicative DNA helicase loader DnaI  24.03 
 
 
315 aa  43.9  0.007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.296741  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2940  DNA replication protein DnaC  29.61 
 
 
331 aa  43.9  0.007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.443717  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1864  IstB domain protein ATP-binding protein  26.09 
 
 
270 aa  43.9  0.008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1802  hypothetical protein  24.54 
 
 
275 aa  43.5  0.009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>