61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MARTH_R31 on replicon NC_011025
Organism: Mycoplasma arthritidis 158L3-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011025  MARTH_R31  tRNA-Gly  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0059  tRNA-Gly  89.23 
 
 		 74 bp  73.8  0.000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_R32  tRNA-Gly  88.33 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0060  tRNA-Gly  85.51 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0058  tRNA-Gly  85.94 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00122195  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14004  tRNA-Gly  85.94 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0004  tRNA-Gly  85.94 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.786418  normal  0.400526 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0007  tRNA-Gly  85.94 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00254544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0004  tRNA-Gly  85.94 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0001  tRNA-Gly  85.94 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.508752  normal  0.0130418 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0004  tRNA-Gly  85.94 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.699145  normal  0.0309415 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0047  tRNA-Gly  85.48 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0039  tRNA-Gly  84.62 
 
 		 71 bp  50.1  0.00007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000000372449  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3852  tRNA-Gly  84.62 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0347948 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0090  tRNA-Gly  84.62 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0023  tRNA-Gly  84.62 
 
 		 71 bp  50.1  0.00007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000259024  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0011  tRNA-Gly  84.62 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0017  tRNA-Gly  84.62 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.77032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0003  tRNA-Gly  84.62 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.564977  normal  0.743111 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0051  tRNA-Gly  84.62 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.637651  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4556  tRNA-Gly  84.62 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0031  tRNA-Gly  84.62 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0003  tRNA-Gly  84.62 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0023  tRNA-Gly  84.62 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0057  tRNA-Gly  84.06 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0033  tRNA-Gly  84.62 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0535197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4211  tRNA-Gly  84.62 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0055  tRNA-Gly  84.62 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.273578  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0003  tRNA-Gly  84.62 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0128  tRNA-Gly  84.62 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.521408 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0003  tRNA-Gly  84.62 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0002  tRNA-Gly  84.62 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0024  tRNA-Gly  85 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35500  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0080  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.12182 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0073  tRNA-Gly  84.48 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.423139  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0023  tRNA-Gly  84.48 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.333471 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0004  tRNA-Gly  84.48 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0022  tRNA-Gly  84.48 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.274402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0073  tRNA-Gly  84.48 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.655574 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0066  tRNA-Gly  84.48 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4154  tRNA-Gly  84.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0729117 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26280  tRNA-Gly  88.1 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.15189 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0014  tRNA-Gly  84.48 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0002    84.48 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.462188  normal  0.531526 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0016  tRNA-Gly  84.48 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5067  tRNA-Gly  84.48 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3372  tRNA-Gly  84.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.564657  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3192  tRNA-Gly  84.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3205  tRNA-Gly  84.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.582072 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3267  tRNA-Gly  84.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3271  tRNA-Gly  84.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0058  tRNA-Gly  84.48 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3531  tRNA-Gly  84.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0003  tRNA-Gly  84.48 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2997  tRNA-Gly  84.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.252272 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0018  tRNA-Gly  84.48 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.268435  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00054  tRNA-Gly  84.48 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.627251  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0078  tRNA-Gly  84.48 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA7  tRNA-Gly  84.48 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00151828 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4697  tRNA-Gly  84.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00274412  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>