42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01779 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_01779  Coq7 family protein  100 
 
 		 192 aa  402  1e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0339  Coq7 family protein  27.22 
 
 		 175 aa  71.6  0.000000000006  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0552133  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3498  ubiquinone biosynthesis protein COQ7  31.13 
 
 		 212 aa  65.1  0.0000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00704542  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1634  ubiquinone biosynthesis protein COQ7  30.67 
 
 		 193 aa  63.5  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.663007  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND01210  ubiquinone metabolism-related protein, putative  29.46 
 
 		 251 aa  60.8  0.00000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0153  ubiquinone biosynthesis protein COQ7  28.18 
 
 		 182 aa  60.5  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0225  Coq7 family protein  25.14 
 
 		 170 aa  58.9  0.00000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3198  ubiquinone biosynthesis protein COQ7  28.49 
 
 		 186 aa  57.4  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.483665  normal  0.470214 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2348  ubiquinone biosynthesis protein COQ7  24.73 
 
 		 193 aa  53.9  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0873  Coq7 family protein  28.81 
 
 		 170 aa  53.9  0.000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0582866  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1100  Coq7 family protein  25.14 
 
 		 180 aa  52  0.000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.977471  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2549  ubiquinone biosynthesis protein COQ7  28.37 
 
 		 163 aa  51.6  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.570699  normal  0.287563 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0053  ubiquinone biosynthesis protein COQ7  27.84 
 
 		 170 aa  51.6  0.000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2793  putative ubiquinone biosynthesis protein  27.97 
 
 		 213 aa  51.2  0.000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00345509  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0572  ubiquinone biosynthesis protein COQ7  26.14 
 
 		 171 aa  49.7  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.672721 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3239  Coq7 family protein  24.69 
 
 		 208 aa  48.5  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0578538  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2840  ubiquinone biosynthesis protein  24.69 
 
 		 208 aa  48.5  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000217276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0549  ubiquinone biosynthesis protein COQ7-like protein  23.73 
 
 		 208 aa  47.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0520  ubiquinone biosynthesis protein COQ7-like protein  23.73 
 
 		 208 aa  47.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2238  Ubiquinone biosynthesis protein COQ7  29.84 
 
 		 198 aa  47.8  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0067  ubiquinone biosynthesis protein COQ7-like  23.73 
 
 		 208 aa  47.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0938  putative ubiquinone biosynthesis protein  22.86 
 
 		 214 aa  47.8  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.290926  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04569  ubiquinone biosynthesis protein Coq7, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01890)  21.58 
 
 		 240 aa  45.8  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.806662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0341  putative ubiquinone biosynthesis protein  24.7 
 
 		 226 aa  45.4  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2163  putative ubiquinone biosynthesis monooxygenase Coq7  23.23 
 
 		 207 aa  45.4  0.0005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0397519 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0912  putative ubiquinone biosynthesis protein  24.53 
 
 		 213 aa  45.1  0.0006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0790  ubiquinone biosynthesis protein  25.57 
 
 		 237 aa  45.1  0.0006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0647  putative ubiquinone biosynthesis protein  23.87 
 
 		 207 aa  45.1  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000028315  normal  0.0960904 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3635  ubiquinone biosynthesis protein COQ7-like  22.29 
 
 		 208 aa  43.9  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0171  putative ubiquinone biosynthesis protein  23.53 
 
 		 209 aa  44.3  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0931  putative ubiquinone biosynthesis protein  22.78 
 
 		 205 aa  43.9  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.694981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_73817  DMQ mono-oxygenase/Ubiquinone biosynthesis protein COQ7/CLK-1/CAT5  27.56 
 
 		 251 aa  43.1  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.551295 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0877  ubiquinone biosynthesis protein  25.15 
 
 		 220 aa  42.4  0.004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00091351  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04009  ubiquinone biosynthesis protein  23.6 
 
 		 217 aa  42  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1108  hypothetical protein  22.99 
 
 		 186 aa  42  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0478  ubiquinone biosynthesis protein COQ7-like protein  21.95 
 
 		 208 aa  42  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0453  ubiquinone biosynthesis protein COQ7-like protein  21.95 
 
 		 208 aa  42  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.633447  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0157  putative ubiquinone biosynthesis protein  22.46 
 
 		 209 aa  41.6  0.007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1087  putative ubiquinone biosynthesis protein  24.71 
 
 		 209 aa  41.6  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.57185  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2846  ubiquinone biosynthesis protein COQ7-like protein  22.56 
 
 		 208 aa  41.2  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.188656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3560  ubiquinone biosynthesis protein  21.84 
 
 		 208 aa  41.2  0.01  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3554  hypothetical protein  21.84 
 
 		 208 aa  41.2  0.01  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.879086  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>