62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2238 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2238  Ubiquinone biosynthesis protein COQ7  100 
 
 
198 aa  401  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0873  Coq7 family protein  35.51 
 
 
170 aa  90.9  1e-17  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0582866  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0225  Coq7 family protein  37.8 
 
 
170 aa  89  4e-17  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0572  ubiquinone biosynthesis protein COQ7  36.31 
 
 
171 aa  86.7  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.672721 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3498  ubiquinone biosynthesis protein COQ7  34.46 
 
 
212 aa  82.8  0.000000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00704542  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2348  ubiquinone biosynthesis protein COQ7  35.33 
 
 
193 aa  82  0.000000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0153  ubiquinone biosynthesis protein COQ7  35.25 
 
 
182 aa  80.5  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1634  ubiquinone biosynthesis protein COQ7  32.56 
 
 
193 aa  79  0.00000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.663007  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3198  ubiquinone biosynthesis protein COQ7  34.43 
 
 
186 aa  77.4  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.483665  normal  0.470214 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2549  ubiquinone biosynthesis protein COQ7  34.11 
 
 
163 aa  77.8  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.570699  normal  0.287563 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04569  ubiquinone biosynthesis protein Coq7, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01890)  31.9 
 
 
240 aa  76.3  0.0000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.806662  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_73817  DMQ mono-oxygenase/Ubiquinone biosynthesis protein COQ7/CLK-1/CAT5  27.37 
 
 
251 aa  75.9  0.0000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.551295 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0339  Coq7 family protein  29.49 
 
 
175 aa  75.9  0.0000000000004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0552133  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0053  ubiquinone biosynthesis protein COQ7  35.94 
 
 
170 aa  74.7  0.0000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1100  Coq7 family protein  30.49 
 
 
180 aa  73.9  0.000000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.977471  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND01210  ubiquinone metabolism-related protein, putative  32.4 
 
 
251 aa  70.1  0.00000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2793  putative ubiquinone biosynthesis protein  30.37 
 
 
213 aa  59.3  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00345509  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3239  Coq7 family protein  30.37 
 
 
208 aa  59.3  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0578538  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2840  ubiquinone biosynthesis protein  30.37 
 
 
208 aa  59.3  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000217276  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0157  putative ubiquinone biosynthesis protein  28.17 
 
 
209 aa  56.2  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2734  hypothetical protein  27.34 
 
 
217 aa  52  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2311  putative ubiquinone biosynthesis protein  27.13 
 
 
212 aa  52  0.000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.251224 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2073  hypothetical protein  23.24 
 
 
215 aa  51.6  0.000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000039677  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3099  hypothetical protein  26.56 
 
 
217 aa  51.2  0.000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0102  2-polyprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  24.05 
 
 
215 aa  51.2  0.00001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.398039  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0938  putative ubiquinone biosynthesis protein  28.12 
 
 
214 aa  51.2  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.290926  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2854  hypothetical protein  27.34 
 
 
211 aa  51.2  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0790  ubiquinone biosynthesis protein  24.84 
 
 
237 aa  50.1  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3712  ubiquinone biosynthesis protein  26.8 
 
 
214 aa  50.1  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.151258  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2683  hypothetical protein  27.94 
 
 
187 aa  50.4  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.936487  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1305  putative ubiquinone biosynthesis protein  29.41 
 
 
208 aa  50.4  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.357891 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3414  putative ubiquinone biosynthesis protein  25 
 
 
216 aa  48.5  0.00006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000230541 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01779  Coq7 family protein  29.84 
 
 
192 aa  47.8  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0171  putative ubiquinone biosynthesis protein  24.68 
 
 
209 aa  47.4  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3138  putative ubiquinone biosynthesis protein  24.22 
 
 
207 aa  46.6  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176892  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3635  ubiquinone biosynthesis protein COQ7-like  27.94 
 
 
208 aa  47  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0877  ubiquinone biosynthesis protein  24.03 
 
 
220 aa  47  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00091351  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0067  ubiquinone biosynthesis protein COQ7-like  25.93 
 
 
208 aa  46.2  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0647  putative ubiquinone biosynthesis protein  28.57 
 
 
207 aa  46.6  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000028315  normal  0.0960904 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0520  ubiquinone biosynthesis protein COQ7-like protein  25.93 
 
 
208 aa  46.2  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0549  ubiquinone biosynthesis protein COQ7-like protein  25.93 
 
 
208 aa  46.2  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0453  ubiquinone biosynthesis protein COQ7-like protein  25.93 
 
 
208 aa  45.8  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.633447  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0478  ubiquinone biosynthesis protein COQ7-like protein  25.93 
 
 
208 aa  45.8  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1087  putative ubiquinone biosynthesis protein  28.12 
 
 
209 aa  45.8  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.57185  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3560  ubiquinone biosynthesis protein  25.9 
 
 
208 aa  45.1  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3554  hypothetical protein  25.9 
 
 
208 aa  45.1  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.879086  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2846  ubiquinone biosynthesis protein COQ7-like protein  25.19 
 
 
208 aa  44.7  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.188656  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1108  hypothetical protein  26.43 
 
 
186 aa  44.7  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3222  hypothetical protein  26.43 
 
 
208 aa  44.3  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1341  hypothetical protein  26.43 
 
 
218 aa  44.3  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.638025  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0482  hypothetical protein  26.43 
 
 
218 aa  44.3  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.687681  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0476  hypothetical protein  26.32 
 
 
212 aa  44.7  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0683128  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2989  putative ubiquinone biosynthesis protein  25 
 
 
207 aa  44.3  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.428403  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2561  hypothetical protein  26.43 
 
 
208 aa  44.3  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.647522  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04009  ubiquinone biosynthesis protein  25.41 
 
 
217 aa  43.9  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3535  putative ubiquinone biosynthesis protein  26.43 
 
 
208 aa  43.5  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46070  Ubiquinone biosynthesis protein  26.32 
 
 
215 aa  43.5  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5683  putative ubiquinone biosynthesis protein  25.81 
 
 
205 aa  43.1  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000723983  normal  0.587683 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0427  hypothetical protein  23.48 
 
 
215 aa  42  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.861838 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0460  ubiquinone biosynthesis protein COQ7-like protein  23.48 
 
 
215 aa  42  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.485558  normal  0.0120401 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0457  ubiquinone biosynthesis protein COQ7  23.48 
 
 
215 aa  41.6  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.314163 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0029  hypothetical protein  28.03 
 
 
213 aa  41.6  0.009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>