39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5782 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_5782  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  100 
 
 		 286 aa  549  1e-155  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0439498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6006  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  82.39 
 
 		 293 aa  348  5e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.416409  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1833  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  68.61 
 
 		 289 aa  338  8e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.498714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2168  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  68.98 
 
 		 289 aa  336  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.790571  normal  0.137566 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1784  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  67.51 
 
 		 291 aa  308  6.999999999999999e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.708464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0532  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  62.04 
 
 		 279 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1656  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  51.69 
 
 		 281 aa  235  6e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000354952  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3533  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  54.55 
 
 		 276 aa  221  9.999999999999999e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.645144 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2389  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  52.92 
 
 		 310 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2865  ATP:dephospho-CoA triphosphoribosyl transferase  46.43 
 
 		 288 aa  176  5e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3148  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  45.86 
 
 		 298 aa  172  6.999999999999999e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5944  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  46.67 
 
 		 312 aa  170  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0163114 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6486  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  48.01 
 
 		 291 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.729723 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3080  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  47.04 
 
 		 315 aa  152  5.9999999999999996e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2435  putative triphosphoribosyl- dephospho-CoA synthetase  46.59 
 
 		 312 aa  145  9e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.581514 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2611  ATP:dephospho-CoA triphosphoribosyl transferase  48.63 
 
 		 297 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.251639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0652  ATP:dephospho-CoA triphosphoribosyl transferase  41.69 
 
 		 306 aa  124  1e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2407  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  35.69 
 
 		 342 aa  107  3e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.457209  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0767  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  32.4 
 
 		 288 aa  83.6  0.000000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1228  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  23.75 
 
 		 293 aa  82.4  0.000000000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1295  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  26.79 
 
 		 293 aa  80.5  0.00000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.967286  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1459  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  25.6 
 
 		 293 aa  77.4  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0740  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  25.94 
 
 		 293 aa  76.3  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.24203  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1215  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  25.26 
 
 		 293 aa  73.2  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.748005 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0036  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  34.16 
 
 		 295 aa  72.4  0.000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2583  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  31.21 
 
 		 277 aa  65.1  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.153542  normal  0.389185 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1108  hypothetical protein  27 
 
 		 268 aa  63.9  0.000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0764  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  32.74 
 
 		 280 aa  62.8  0.000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0134158  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1728  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  30.68 
 
 		 268 aa  62.4  0.000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0213  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  28.43 
 
 		 315 aa  59.3  0.00000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1415  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  28.93 
 
 		 273 aa  58.2  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.231859  normal  0.121023 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0684  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  26.95 
 
 		 272 aa  54.3  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.383906 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1606  putative triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  27.56 
 
 		 347 aa  53.1  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0666  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  25.38 
 
 		 272 aa  51.6  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.308218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4592  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  33.93 
 
 		 315 aa  47.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2439  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  37.04 
 
 		 301 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.045617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1891  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  30.56 
 
 		 283 aa  45.8  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2882  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  32.41 
 
 		 312 aa  43.5  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0947  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  32.71 
 
 		 294 aa  42.4  0.01  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.908595  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>