39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2435 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2435  putative triphosphoribosyl- dephospho-CoA synthetase  100 
 
 		 312 aa  625  1e-178  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.581514 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6486  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  64.73 
 
 		 291 aa  300  2e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.729723 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5944  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  52.78 
 
 		 312 aa  248  1e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0163114 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3148  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  47.06 
 
 		 298 aa  218  7e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3080  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  49.33 
 
 		 315 aa  215  7e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1656  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  44.07 
 
 		 281 aa  195  8.000000000000001e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000354952  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3533  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  44.07 
 
 		 276 aa  191  1e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.645144 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2611  ATP:dephospho-CoA triphosphoribosyl transferase  54.14 
 
 		 297 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.251639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0532  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  45.59 
 
 		 279 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2389  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  47.22 
 
 		 310 aa  172  7.999999999999999e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1833  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  44.48 
 
 		 289 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.498714  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2865  ATP:dephospho-CoA triphosphoribosyl transferase  40.77 
 
 		 288 aa  163  3e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2168  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  44.48 
 
 		 289 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.790571  normal  0.137566 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1784  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  41.95 
 
 		 291 aa  158  1e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.708464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0652  ATP:dephospho-CoA triphosphoribosyl transferase  41.36 
 
 		 306 aa  157  2e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5782  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  46.59 
 
 		 286 aa  139  6e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0439498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6006  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  48.28 
 
 		 293 aa  137  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.416409  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2407  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  30.23 
 
 		 342 aa  99  8e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.457209  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1459  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  26.21 
 
 		 293 aa  97.8  2e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1215  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  25.86 
 
 		 293 aa  94.7  2e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.748005 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1295  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  26.21 
 
 		 293 aa  94.4  2e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.967286  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0740  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  26.21 
 
 		 293 aa  91.3  2e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.24203  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1415  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  30.18 
 
 		 273 aa  86.3  6e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.231859  normal  0.121023 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1228  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  24.57 
 
 		 293 aa  85.9  9e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0036  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  32.98 
 
 		 295 aa  85.5  0.000000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0767  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  28.99 
 
 		 288 aa  84.7  0.000000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1728  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  30 
 
 		 268 aa  83.6  0.000000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1891  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  30.94 
 
 		 283 aa  79.3  0.00000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2583  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  33.81 
 
 		 277 aa  74.7  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.153542  normal  0.389185 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0684  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  28.31 
 
 		 272 aa  73.6  0.000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.383906 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1606  putative triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  27.15 
 
 		 347 aa  73.6  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0764  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  31.1 
 
 		 280 aa  71.6  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0134158  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0213  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  24.39 
 
 		 315 aa  66.6  0.0000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0666  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  27.55 
 
 		 272 aa  58.9  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.308218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1108  hypothetical protein  25.19 
 
 		 268 aa  56.2  0.0000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0126  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  22.79 
 
 		 295 aa  53.1  0.000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.090418  hitchhiker  0.00094044 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1130  hypothetical protein  32.59 
 
 		 302 aa  48.1  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.167904  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1192  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  22.22 
 
 		 295 aa  45.4  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04700  Triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  21.07 
 
 		 467 aa  42.4  0.01  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>