45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1415 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_1415  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  100 
 
 
273 aa  561  1.0000000000000001e-159  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.231859  normal  0.121023 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1728  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  67.91 
 
 
268 aa  382  1e-105  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0684  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  59.56 
 
 
272 aa  330  1e-89  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.383906 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1108  hypothetical protein  55.81 
 
 
268 aa  293  2e-78  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0666  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  53.68 
 
 
272 aa  292  3e-78  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.308218  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0213  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  41.38 
 
 
315 aa  201  9e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1606  putative triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  38.29 
 
 
347 aa  193  2e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0767  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  39.05 
 
 
288 aa  187  1e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2583  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  39.64 
 
 
277 aa  180  2e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.153542  normal  0.389185 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0764  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  39.86 
 
 
280 aa  172  3.9999999999999995e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0134158  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0036  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  39.02 
 
 
295 aa  171  7.999999999999999e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1891  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  41.01 
 
 
283 aa  152  7e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2336  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  36.83 
 
 
322 aa  133  3e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0290582  normal  0.194172 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1295  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  30.77 
 
 
293 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.967286  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1459  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  29.86 
 
 
293 aa  116  3e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0740  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  29.5 
 
 
293 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.24203  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1215  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  29.56 
 
 
293 aa  115  6e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.748005 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1228  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  27.74 
 
 
293 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2435  putative triphosphoribosyl- dephospho-CoA synthetase  29.09 
 
 
312 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.581514 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1192  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  25.47 
 
 
295 aa  75.9  0.0000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5944  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  29.23 
 
 
312 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0163114 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1833  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  30.11 
 
 
289 aa  72.8  0.000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.498714  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6486  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  32.73 
 
 
291 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.729723 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3533  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  31.68 
 
 
276 aa  70.1  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.645144 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3148  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  26.51 
 
 
298 aa  70.1  0.00000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0126  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  26.19 
 
 
295 aa  68.9  0.00000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.090418  hitchhiker  0.00094044 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2168  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  29.75 
 
 
289 aa  68.9  0.00000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.790571  normal  0.137566 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1656  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  27.3 
 
 
281 aa  65.1  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000354952  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3080  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  28.9 
 
 
315 aa  62  0.000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2389  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  33.59 
 
 
310 aa  62  0.000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0532  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  29.23 
 
 
279 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1784  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  27.82 
 
 
291 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.708464  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2865  ATP:dephospho-CoA triphosphoribosyl transferase  26.99 
 
 
288 aa  47.8  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0635  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  25.7 
 
 
292 aa  47  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.474806  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3031  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  25.7 
 
 
292 aa  46.6  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00581  triphosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  25.7 
 
 
292 aa  46.6  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00570  hypothetical protein  25.7 
 
 
292 aa  46.6  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0664  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  25.7 
 
 
292 aa  46.6  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3012  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase CitG  25.7 
 
 
292 aa  46.6  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.139818  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0527  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  26.52 
 
 
292 aa  46.2  0.0006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0701  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  25.35 
 
 
290 aa  45.4  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5782  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  30.71 
 
 
286 aa  45.4  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0439498  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0632  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  26.48 
 
 
292 aa  45.4  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2611  ATP:dephospho-CoA triphosphoribosyl transferase  29.63 
 
 
297 aa  45.4  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.251639  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1130  hypothetical protein  32.61 
 
 
302 aa  42.7  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.167904  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>