36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0684 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_0684  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  100 
 
 
272 aa  560  1e-158  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.383906 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1728  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  63.16 
 
 
268 aa  350  1e-95  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1415  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  59.56 
 
 
273 aa  330  1e-89  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.231859  normal  0.121023 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0666  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  53.38 
 
 
272 aa  293  2e-78  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.308218  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1108  hypothetical protein  54.14 
 
 
268 aa  276  3e-73  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1606  putative triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  38.24 
 
 
347 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0213  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  41.55 
 
 
315 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0767  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  38.18 
 
 
288 aa  182  6e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2583  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  38.99 
 
 
277 aa  165  9e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.153542  normal  0.389185 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0764  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  37.68 
 
 
280 aa  159  4e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0134158  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1891  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  39.47 
 
 
283 aa  140  3e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0036  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  36.93 
 
 
295 aa  132  6e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2336  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  33.02 
 
 
322 aa  118  7.999999999999999e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0290582  normal  0.194172 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1459  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  28.57 
 
 
293 aa  112  7.000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1295  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  29.35 
 
 
293 aa  108  1e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.967286  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0740  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  28.57 
 
 
293 aa  108  1e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.24203  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1215  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  27.11 
 
 
293 aa  105  6e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.748005 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1228  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  26.01 
 
 
293 aa  100  3e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0532  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  31.54 
 
 
279 aa  69.3  0.00000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2435  putative triphosphoribosyl- dephospho-CoA synthetase  28.31 
 
 
312 aa  67  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.581514 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1192  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  24.91 
 
 
295 aa  61.6  0.00000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3148  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  27.46 
 
 
298 aa  59.7  0.00000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1833  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  28.73 
 
 
289 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.498714  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0126  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  24.32 
 
 
295 aa  58.5  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.090418  hitchhiker  0.00094044 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3533  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  31.7 
 
 
276 aa  57.4  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.645144 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2168  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  28.73 
 
 
289 aa  56.2  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.790571  normal  0.137566 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1656  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  26.09 
 
 
281 aa  51.6  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000354952  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6486  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  30.64 
 
 
291 aa  50.8  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.729723 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2407  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  25.16 
 
 
342 aa  50.1  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.457209  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4926  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  28.36 
 
 
314 aa  47  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.82021  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0328  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase CitG  27.96 
 
 
286 aa  46.6  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2389  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  31.3 
 
 
310 aa  46.2  0.0005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5944  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  27.61 
 
 
312 aa  45.8  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0163114 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1130  hypothetical protein  30.19 
 
 
302 aa  45.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.167904  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2865  ATP:dephospho-CoA triphosphoribosyl transferase  28.26 
 
 
288 aa  44.3  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5782  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  30.33 
 
 
286 aa  43.5  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0439498  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>