38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2389 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2389  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  100 
 
 		 310 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1656  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  49.13 
 
 		 281 aa  250  2e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000354952  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1833  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  51.55 
 
 		 289 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.498714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2168  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  51.55 
 
 		 289 aa  241  1e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.790571  normal  0.137566 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5782  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  54.48 
 
 		 286 aa  217  2e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0439498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1784  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  51.19 
 
 		 291 aa  217  2e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.708464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0532  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  47.55 
 
 		 279 aa  212  7e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3533  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  51.23 
 
 		 276 aa  211  1e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.645144 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6006  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  54.61 
 
 		 293 aa  202  8e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.416409  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3148  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  45.28 
 
 		 298 aa  189  5e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6486  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  50.7 
 
 		 291 aa  186  4e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.729723 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2435  putative triphosphoribosyl- dephospho-CoA synthetase  47.92 
 
 		 312 aa  181  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.581514 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5944  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  44.37 
 
 		 312 aa  180  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0163114 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2865  ATP:dephospho-CoA triphosphoribosyl transferase  43.01 
 
 		 288 aa  177  2e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3080  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  43.46 
 
 		 315 aa  158  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2611  ATP:dephospho-CoA triphosphoribosyl transferase  48.42 
 
 		 297 aa  138  1e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.251639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0652  ATP:dephospho-CoA triphosphoribosyl transferase  38.71 
 
 		 306 aa  130  3e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2407  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  32.15 
 
 		 342 aa  95.1  1e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.457209  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1295  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  27.43 
 
 		 293 aa  91.7  1e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.967286  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1728  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  32.59 
 
 		 268 aa  88.2  1e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1228  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  25.69 
 
 		 293 aa  87.8  2e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1459  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  26.48 
 
 		 293 aa  83.2  0.000000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0740  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  26.22 
 
 		 293 aa  82.8  0.000000000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.24203  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1415  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  30.37 
 
 		 273 aa  80.9  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.231859  normal  0.121023 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0767  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  29.93 
 
 		 288 aa  81.6  0.00000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1108  hypothetical protein  28.46 
 
 		 268 aa  80.1  0.00000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0036  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  32.27 
 
 		 295 aa  79.7  0.00000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1215  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  24.83 
 
 		 293 aa  76.6  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.748005 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2583  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  30 
 
 		 277 aa  65.5  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.153542  normal  0.389185 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1891  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  32.49 
 
 		 283 aa  61.2  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0684  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  28.1 
 
 		 272 aa  60.1  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.383906 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0764  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  29.89 
 
 		 280 aa  60.1  0.00000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0134158  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0666  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  26.26 
 
 		 272 aa  57.4  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.308218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0213  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  26.85 
 
 		 315 aa  55.1  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1606  putative triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  25.16 
 
 		 347 aa  48.5  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0126  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  24.54 
 
 		 295 aa  46.2  0.0006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.090418  hitchhiker  0.00094044 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4592  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  34.48 
 
 		 315 aa  42.7  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1130  hypothetical protein  36.97 
 
 		 302 aa  42.7  0.008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.167904  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>