77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2913 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_2913  phosphonate C-P lyase system protein PhnH  100 
 
 
201 aa  375  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4208  phosphonate C-P lyase system protein PhnH  76.12 
 
 
196 aa  262  3e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3856  phosphonate C-P lyase system protein PhnH  67.68 
 
 
195 aa  221  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.905115 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1315  phosphonate metabolism  60.82 
 
 
211 aa  189  2e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.205505  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2195  phosphonate metabolism  47.94 
 
 
209 aa  167  8e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4437  carbon-phosphorus lyase complex subunit  46.23 
 
 
202 aa  159  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0761  carbon-phosphorus lyase complex subunit  43.72 
 
 
200 aa  158  4e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1285  carbon-phosphorus lyase complex subunit  47.94 
 
 
203 aa  157  8e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.603279  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4123  carbon-phosphorus lyase complex subunit  45.73 
 
 
202 aa  154  7e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5847  carbon-phosphorus lyase complex subunit  43.88 
 
 
203 aa  151  7e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.515972  normal  0.715691 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4090  carbon-phosphorus lyase complex subunit  47.47 
 
 
204 aa  149  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.183624  normal  0.0413085 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6097  phosphonate C-P lyase system protein PhnH  46.53 
 
 
210 aa  145  4.0000000000000006e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.965352  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3826  carbon-phosphorus lyase complex subunit  46.73 
 
 
202 aa  145  5e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.441837  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4187  carbon-phosphorus lyase complex subunit  46.94 
 
 
206 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.908259  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0765  carbon-phosphorus lyase complex subunit  46.23 
 
 
205 aa  134  8e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.269741  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0144  phosphonate metabolism  43.94 
 
 
199 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.038132  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3329  putative PhnH protein, phosphonate metabolism, function unknown  38.69 
 
 
203 aa  132  3e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4234  carbon-phosphorus lyase complex subunit  42.11 
 
 
200 aa  130  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0769065  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2923  phosphonate C-P lyase system protein PhnH  46.39 
 
 
206 aa  126  2.0000000000000002e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.187632  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2958  phosphonate metabolism  42.66 
 
 
235 aa  123  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0607553  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0814  phosphonate C-P lyase system protein PhnH  36.92 
 
 
201 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3774  carbon-phosphorus lyase complex subunit  41.71 
 
 
215 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0269  hypothetical protein  39.46 
 
 
181 aa  117  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.709175  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4781  carbon-phosphorus lyase complex subunit  44.72 
 
 
188 aa  110  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.259946  normal  0.333333 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5941  carbon-phosphorus lyase complex subunit  40.5 
 
 
207 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2180  carbon-phosphorus lyase complex subunit  40.2 
 
 
203 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.120868 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3344  carbon-phosphorus lyase complex subunit  41.26 
 
 
209 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.148755  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0304  carbon-phosphorus lyase complex subunit  37.5 
 
 
194 aa  108  6e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.464076  normal  0.118863 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0317  carbon-phosphorus lyase complex subunit  41.38 
 
 
209 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2401  carbon-phosphorus lyase complex subunit  41.38 
 
 
207 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3355  carbon-phosphorus lyase complex subunit  41.38 
 
 
207 aa  107  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1178  carbon-phosphorus lyase complex subunit  41.38 
 
 
209 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3310  carbon-phosphorus lyase complex subunit  41.38 
 
 
209 aa  107  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2587  carbon-phosphorus lyase complex subunit  41.38 
 
 
209 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1750  carbon-phosphorus lyase complex subunit  41.12 
 
 
209 aa  106  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.197013  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20370  carbon-phosphorus lyase complex subunit  41.5 
 
 
209 aa  106  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.481874  normal  0.778261 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3891  phosphonate C-P lyase system protein PhnH  37 
 
 
194 aa  102  4e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1309  phosphonate C-P lyase system protein PhnH  40.41 
 
 
197 aa  102  4e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0225857  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03932  hypothetical protein  37 
 
 
194 aa  102  5e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03972  carbon-phosphorus lyase complex subunit  37 
 
 
194 aa  102  5e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3926  carbon-phosphorus lyase complex subunit  37 
 
 
194 aa  102  5e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2693  phosphonate C-P lyase system protein PhnH  41 
 
 
191 aa  101  7e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5613  carbon-phosphorus lyase complex subunit  37 
 
 
194 aa  101  9e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4566  carbon-phosphorus lyase complex subunit  36.5 
 
 
194 aa  101  9e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4654  carbon-phosphorus lyase complex subunit  37 
 
 
194 aa  100  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4030  carbon-phosphorus lyase complex subunit  34.74 
 
 
208 aa  101  1e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4341  carbon-phosphorus lyase complex subunit  37 
 
 
194 aa  100  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3561  carbon-phosphorus lyase complex subunit  34.74 
 
 
208 aa  101  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2885  carbon-phosphorus lyase complex subunit  40.91 
 
 
203 aa  100  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0603135  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3695  carbon-phosphorus lyase complex subunit  34.74 
 
 
208 aa  100  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.897186  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2252  carbon-phosphorus lyase complex subunit  40.59 
 
 
198 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0116362  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3702  carbon-phosphorus lyase complex subunit  38.34 
 
 
191 aa  96.7  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.318645 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0520  carbon-phosphorus lyase complex subunit  34.65 
 
 
193 aa  89.7  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.91344  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2560  PhnH protein  37.75 
 
 
198 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.37097  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0888  phosphonate C-P lyase system protein PhnH  33.33 
 
 
191 aa  81.6  0.000000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0576  carbon-phosphorus lyase complex subunit  29.35 
 
 
193 aa  70.5  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0480  carbon-phosphorus lyase complex subunit  29.35 
 
 
193 aa  68.6  0.00000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3511  phosphonate C-P lyase system protein PhnH  33.5 
 
 
208 aa  66.6  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1926  phosphonate C-P lyase system protein PhnH  33.51 
 
 
180 aa  65.1  0.0000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.50806  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2279  phosphonate metabolism protein phnH  33.51 
 
 
180 aa  65.1  0.0000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2912  phosphonate metabolism  39.6 
 
 
187 aa  62.8  0.000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0229  phosphonate C-P lyase system protein PhnH  32.08 
 
 
337 aa  62.8  0.000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.202228  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2295  carbon-phosphorus lyase complex subunit  32.98 
 
 
193 aa  61.2  0.000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4602  protein PhnH  39.8 
 
 
97 aa  61.2  0.000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1002  carbon-phosphorus lyase complex subunit  26.6 
 
 
185 aa  58.9  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0973  carbon-phosphorus lyase complex subunit  26.6 
 
 
185 aa  58.9  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2083  carbon-phosphorus lyase complex subunit  28.42 
 
 
202 aa  58.2  0.00000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3691  carbon-phosphorus lyase complex subunit  28.72 
 
 
202 aa  57  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0425  carbon-phosphorus lyase complex subunit  38.04 
 
 
195 aa  52.4  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0461  carbon-phosphorus lyase complex subunit  38.04 
 
 
195 aa  52.4  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0700818  normal 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4148  carbon-phosphorus lyase complex subunit  30.65 
 
 
197 aa  52  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2290  carbon-phosphorus lyase complex subunit  30.65 
 
 
197 aa  51.2  0.000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0218  carbon-phosphorus lyase complex subunit  29.95 
 
 
192 aa  50.8  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4038  carbon-phosphorus lyase complex subunit  29.95 
 
 
192 aa  50.8  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.724811  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1590  hypothetical protein  27.92 
 
 
210 aa  49.3  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5872  hypothetical protein  35.75 
 
 
187 aa  44.7  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4998  carbon-phosphorus lyase complex subunit  30.81 
 
 
192 aa  44.3  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0115645  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>