69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_1750 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1750  carbon-phosphorus lyase complex subunit  100 
 
 
209 aa  407  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.197013  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20370  carbon-phosphorus lyase complex subunit  95.22 
 
 
209 aa  367  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.481874  normal  0.778261 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2885  carbon-phosphorus lyase complex subunit  70.71 
 
 
203 aa  273  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0603135  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2560  PhnH protein  61.66 
 
 
198 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.37097  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2252  carbon-phosphorus lyase complex subunit  62.69 
 
 
198 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0116362  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0304  carbon-phosphorus lyase complex subunit  39.68 
 
 
194 aa  129  3e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.464076  normal  0.118863 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2693  phosphonate C-P lyase system protein PhnH  42.7 
 
 
191 aa  128  8.000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4654  carbon-phosphorus lyase complex subunit  38.1 
 
 
194 aa  125  6e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3891  phosphonate C-P lyase system protein PhnH  37.57 
 
 
194 aa  124  8.000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3926  carbon-phosphorus lyase complex subunit  37.57 
 
 
194 aa  124  1e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03972  carbon-phosphorus lyase complex subunit  37.57 
 
 
194 aa  124  1e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4341  carbon-phosphorus lyase complex subunit  38.1 
 
 
194 aa  124  1e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03932  hypothetical protein  37.57 
 
 
194 aa  124  1e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5613  carbon-phosphorus lyase complex subunit  38.1 
 
 
194 aa  123  2e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0888  phosphonate C-P lyase system protein PhnH  39.57 
 
 
191 aa  122  3e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4437  carbon-phosphorus lyase complex subunit  38.86 
 
 
202 aa  121  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0520  carbon-phosphorus lyase complex subunit  37.5 
 
 
193 aa  120  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.91344  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5847  carbon-phosphorus lyase complex subunit  39.49 
 
 
203 aa  119  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.515972  normal  0.715691 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4123  carbon-phosphorus lyase complex subunit  39.38 
 
 
202 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4566  carbon-phosphorus lyase complex subunit  37.04 
 
 
194 aa  118  6e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4090  carbon-phosphorus lyase complex subunit  38.54 
 
 
204 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.183624  normal  0.0413085 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3826  carbon-phosphorus lyase complex subunit  37.82 
 
 
202 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.441837  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1285  carbon-phosphorus lyase complex subunit  38.38 
 
 
203 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.603279  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0144  phosphonate metabolism  43.81 
 
 
199 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.038132  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1309  phosphonate C-P lyase system protein PhnH  38.1 
 
 
197 aa  115  6e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0225857  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1178  carbon-phosphorus lyase complex subunit  39.39 
 
 
209 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3310  carbon-phosphorus lyase complex subunit  39.39 
 
 
209 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3344  carbon-phosphorus lyase complex subunit  39.39 
 
 
209 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.148755  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2587  carbon-phosphorus lyase complex subunit  39.39 
 
 
209 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0317  carbon-phosphorus lyase complex subunit  39.39 
 
 
209 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2401  carbon-phosphorus lyase complex subunit  39.39 
 
 
207 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3355  carbon-phosphorus lyase complex subunit  39.39 
 
 
207 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2180  carbon-phosphorus lyase complex subunit  41.67 
 
 
203 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.120868 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4030  carbon-phosphorus lyase complex subunit  35.68 
 
 
208 aa  114  1.0000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3561  carbon-phosphorus lyase complex subunit  35.68 
 
 
208 aa  114  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3329  putative PhnH protein, phosphonate metabolism, function unknown  36.32 
 
 
203 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3695  carbon-phosphorus lyase complex subunit  35.68 
 
 
208 aa  113  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.897186  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6097  phosphonate C-P lyase system protein PhnH  42.65 
 
 
210 aa  112  4.0000000000000004e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.965352  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2923  phosphonate C-P lyase system protein PhnH  45.05 
 
 
206 aa  111  6e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.187632  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4234  carbon-phosphorus lyase complex subunit  38.74 
 
 
200 aa  111  7.000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0769065  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4208  phosphonate C-P lyase system protein PhnH  41.45 
 
 
196 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3856  phosphonate C-P lyase system protein PhnH  40.93 
 
 
195 aa  109  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.905115 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0761  carbon-phosphorus lyase complex subunit  36.73 
 
 
200 aa  108  5e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5941  carbon-phosphorus lyase complex subunit  40.93 
 
 
207 aa  108  5e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0765  carbon-phosphorus lyase complex subunit  39.9 
 
 
205 aa  107  9.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.269741  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3774  carbon-phosphorus lyase complex subunit  37.5 
 
 
215 aa  106  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0269  hypothetical protein  37.57 
 
 
181 aa  104  8e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.709175  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4781  carbon-phosphorus lyase complex subunit  39.68 
 
 
188 aa  102  5e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.259946  normal  0.333333 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4187  carbon-phosphorus lyase complex subunit  38.83 
 
 
206 aa  100  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.908259  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3702  carbon-phosphorus lyase complex subunit  35.71 
 
 
191 aa  100  1e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.318645 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0576  carbon-phosphorus lyase complex subunit  32.26 
 
 
193 aa  92  5e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0480  carbon-phosphorus lyase complex subunit  32.43 
 
 
193 aa  90.5  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2195  phosphonate metabolism  32.65 
 
 
209 aa  88.6  5e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2279  phosphonate metabolism protein phnH  33.15 
 
 
180 aa  87.8  9e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1926  phosphonate C-P lyase system protein PhnH  33.15 
 
 
180 aa  87.8  9e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.50806  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1315  phosphonate metabolism  38.78 
 
 
211 aa  82  0.000000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.205505  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0814  phosphonate C-P lyase system protein PhnH  31.91 
 
 
201 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2913  phosphonate C-P lyase system protein PhnH  37.69 
 
 
201 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2958  phosphonate metabolism  33.8 
 
 
235 aa  66.6  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0607553  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4602  protein PhnH  38.37 
 
 
97 aa  61.6  0.000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2912  phosphonate metabolism  35.11 
 
 
187 aa  58.5  0.00000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3511  phosphonate C-P lyase system protein PhnH  34.17 
 
 
208 aa  55.1  0.0000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0218  carbon-phosphorus lyase complex subunit  29.44 
 
 
192 aa  49.7  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4038  carbon-phosphorus lyase complex subunit  29.44 
 
 
192 aa  49.7  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.724811  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2083  carbon-phosphorus lyase complex subunit  26.49 
 
 
202 aa  46.2  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1002  carbon-phosphorus lyase complex subunit  35.06 
 
 
185 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0973  carbon-phosphorus lyase complex subunit  35.06 
 
 
185 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1590  hypothetical protein  30.15 
 
 
210 aa  43.5  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2295  carbon-phosphorus lyase complex subunit  30 
 
 
193 aa  43.9  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>