75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5847 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5847  carbon-phosphorus lyase complex subunit  100 
 
 		 203 aa  399  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.515972  normal  0.715691 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1285  carbon-phosphorus lyase complex subunit  60.2 
 
 		 203 aa  233  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.603279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0761  carbon-phosphorus lyase complex subunit  57.29 
 
 		 200 aa  218  3e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4090  carbon-phosphorus lyase complex subunit  54.31 
 
 		 204 aa  201  5e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.183624  normal  0.0413085 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3826  carbon-phosphorus lyase complex subunit  54.82 
 
 		 202 aa  194  7e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.441837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4208  phosphonate C-P lyase system protein PhnH  45.31 
 
 		 196 aa  154  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3856  phosphonate C-P lyase system protein PhnH  44.85 
 
 		 195 aa  154  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.905115 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4437  carbon-phosphorus lyase complex subunit  40.51 
 
 		 202 aa  150  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2195  phosphonate metabolism  41.09 
 
 		 209 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4234  carbon-phosphorus lyase complex subunit  40.21 
 
 		 200 aa  141  7e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0769065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4123  carbon-phosphorus lyase complex subunit  42.79 
 
 		 202 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1315  phosphonate metabolism  44.85 
 
 		 211 aa  139  3e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.205505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3329  putative PhnH protein, phosphonate metabolism, function unknown  38.34 
 
 		 203 aa  132  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0765  carbon-phosphorus lyase complex subunit  42.19 
 
 		 205 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.269741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0144  phosphonate metabolism  38.14 
 
 		 199 aa  128  6e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.038132  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2180  carbon-phosphorus lyase complex subunit  41.15 
 
 		 203 aa  128  6e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.120868 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0814  phosphonate C-P lyase system protein PhnH  39.15 
 
 		 201 aa  127  9.000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2923  phosphonate C-P lyase system protein PhnH  39.3 
 
 		 206 aa  126  3e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.187632  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0269  hypothetical protein  41.62 
 
 		 181 aa  124  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.709175  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4187  carbon-phosphorus lyase complex subunit  40.74 
 
 		 206 aa  122  5e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.908259  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6097  phosphonate C-P lyase system protein PhnH  39.5 
 
 		 210 aa  120  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.965352  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0317  carbon-phosphorus lyase complex subunit  43.78 
 
 		 209 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3344  carbon-phosphorus lyase complex subunit  41.12 
 
 		 209 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.148755  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1178  carbon-phosphorus lyase complex subunit  43.78 
 
 		 209 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3310  carbon-phosphorus lyase complex subunit  43.78 
 
 		 209 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2401  carbon-phosphorus lyase complex subunit  41.12 
 
 		 207 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3355  carbon-phosphorus lyase complex subunit  43.78 
 
 		 207 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2587  carbon-phosphorus lyase complex subunit  43.78 
 
 		 209 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2885  carbon-phosphorus lyase complex subunit  39.9 
 
 		 203 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0603135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3774  carbon-phosphorus lyase complex subunit  40.1 
 
 		 215 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5941  carbon-phosphorus lyase complex subunit  39.06 
 
 		 207 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1750  carbon-phosphorus lyase complex subunit  39.06 
 
 		 209 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.197013  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20370  carbon-phosphorus lyase complex subunit  38.54 
 
 		 209 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.481874  normal  0.778261 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4566  carbon-phosphorus lyase complex subunit  38.86 
 
 		 194 aa  109  3e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5613  carbon-phosphorus lyase complex subunit  38.86 
 
 		 194 aa  108  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1309  phosphonate C-P lyase system protein PhnH  38.54 
 
 		 197 aa  108  5e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0225857  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0304  carbon-phosphorus lyase complex subunit  36.98 
 
 		 194 aa  108  7.000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.464076  normal  0.118863 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3891  phosphonate C-P lyase system protein PhnH  37.82 
 
 		 194 aa  107  8.000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03932  hypothetical protein  37.82 
 
 		 194 aa  107  9.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03972  carbon-phosphorus lyase complex subunit  37.82 
 
 		 194 aa  107  9.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3926  carbon-phosphorus lyase complex subunit  37.82 
 
 		 194 aa  107  9.000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4341  carbon-phosphorus lyase complex subunit  38.34 
 
 		 194 aa  107  1e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4654  carbon-phosphorus lyase complex subunit  38.86 
 
 		 194 aa  107  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2958  phosphonate metabolism  35.14 
 
 		 235 aa  107  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0607553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2252  carbon-phosphorus lyase complex subunit  39.18 
 
 		 198 aa  106  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0116362  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2693  phosphonate C-P lyase system protein PhnH  38.3 
 
 		 191 aa  104  8e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2279  phosphonate metabolism protein phnH  37.3 
 
 		 180 aa  103  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1926  phosphonate C-P lyase system protein PhnH  37.3 
 
 		 180 aa  103  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.50806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3702  carbon-phosphorus lyase complex subunit  35.42 
 
 		 191 aa  103  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.318645 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4030  carbon-phosphorus lyase complex subunit  32.2 
 
 		 208 aa  101  9e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3561  carbon-phosphorus lyase complex subunit  32.2 
 
 		 208 aa  101  9e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2913  phosphonate C-P lyase system protein PhnH  43.88 
 
 		 201 aa  100  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3695  carbon-phosphorus lyase complex subunit  32.2 
 
 		 208 aa  100  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.897186  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2560  PhnH protein  36.6 
 
 		 198 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.37097  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0520  carbon-phosphorus lyase complex subunit  34.38 
 
 		 193 aa  94.7  9e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.91344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4781  carbon-phosphorus lyase complex subunit  38.89 
 
 		 188 aa  94  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.259946  normal  0.333333 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0888  phosphonate C-P lyase system protein PhnH  34.38 
 
 		 191 aa  91.7  6e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0576  carbon-phosphorus lyase complex subunit  32.98 
 
 		 193 aa  84  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0480  carbon-phosphorus lyase complex subunit  32.46 
 
 		 193 aa  80.5  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3511  phosphonate C-P lyase system protein PhnH  34.01 
 
 		 208 aa  72  0.000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0973  carbon-phosphorus lyase complex subunit  30.65 
 
 		 185 aa  70.5  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1002  carbon-phosphorus lyase complex subunit  30.65 
 
 		 185 aa  70.5  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0218  carbon-phosphorus lyase complex subunit  34.16 
 
 		 192 aa  68.9  0.00000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4038  carbon-phosphorus lyase complex subunit  34.16 
 
 		 192 aa  68.9  0.00000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.724811  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2912  phosphonate metabolism  35.57 
 
 		 187 aa  66.2  0.0000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3691  carbon-phosphorus lyase complex subunit  29.63 
 
 		 202 aa  64.7  0.0000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2295  carbon-phosphorus lyase complex subunit  30.73 
 
 		 193 aa  62.4  0.000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2083  carbon-phosphorus lyase complex subunit  29.73 
 
 		 202 aa  61.2  0.000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4602  protein PhnH  38.78 
 
 		 97 aa  58.2  0.00000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4148  carbon-phosphorus lyase complex subunit  30.6 
 
 		 197 aa  54.7  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1590  hypothetical protein  28.5 
 
 		 210 aa  54.3  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2290  carbon-phosphorus lyase complex subunit  31.55 
 
 		 197 aa  53.9  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0425  carbon-phosphorus lyase complex subunit  35.87 
 
 		 195 aa  51.2  0.000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0461  carbon-phosphorus lyase complex subunit  35.87 
 
 		 195 aa  51.2  0.000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0700818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4998  carbon-phosphorus lyase complex subunit  26.67 
 
 		 192 aa  44.3  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0115645  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>