60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4998 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_4998  carbon-phosphorus lyase complex subunit  100 
 
 
192 aa  387  1e-107  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0115645  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0973  carbon-phosphorus lyase complex subunit  51.93 
 
 
185 aa  186  1e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1002  carbon-phosphorus lyase complex subunit  51.93 
 
 
185 aa  186  1e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2295  carbon-phosphorus lyase complex subunit  41.21 
 
 
193 aa  151  5e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2083  carbon-phosphorus lyase complex subunit  40.41 
 
 
202 aa  137  7e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3691  carbon-phosphorus lyase complex subunit  38.66 
 
 
202 aa  130  1.0000000000000001e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4038  carbon-phosphorus lyase complex subunit  40.45 
 
 
192 aa  118  6e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.724811  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0218  carbon-phosphorus lyase complex subunit  40.45 
 
 
192 aa  118  6e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0461  carbon-phosphorus lyase complex subunit  36.76 
 
 
195 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0700818  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0425  carbon-phosphorus lyase complex subunit  36.76 
 
 
195 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4148  carbon-phosphorus lyase complex subunit  37.57 
 
 
197 aa  111  7.000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2290  carbon-phosphorus lyase complex subunit  37.57 
 
 
197 aa  111  8.000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1309  phosphonate C-P lyase system protein PhnH  35.14 
 
 
197 aa  66.6  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0225857  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4654  carbon-phosphorus lyase complex subunit  33.89 
 
 
194 aa  65.9  0.0000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03932  hypothetical protein  33.89 
 
 
194 aa  64.7  0.0000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03972  carbon-phosphorus lyase complex subunit  33.89 
 
 
194 aa  64.7  0.0000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3926  carbon-phosphorus lyase complex subunit  33.89 
 
 
194 aa  64.7  0.0000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3891  phosphonate C-P lyase system protein PhnH  33.89 
 
 
194 aa  64.7  0.0000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5613  carbon-phosphorus lyase complex subunit  33.33 
 
 
194 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4341  carbon-phosphorus lyase complex subunit  33.33 
 
 
194 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4566  carbon-phosphorus lyase complex subunit  33.89 
 
 
194 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3355  carbon-phosphorus lyase complex subunit  31.5 
 
 
207 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2401  carbon-phosphorus lyase complex subunit  31.5 
 
 
207 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2587  carbon-phosphorus lyase complex subunit  31.5 
 
 
209 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3344  carbon-phosphorus lyase complex subunit  31.5 
 
 
209 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.148755  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1178  carbon-phosphorus lyase complex subunit  31.5 
 
 
209 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0317  carbon-phosphorus lyase complex subunit  31.5 
 
 
209 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3310  carbon-phosphorus lyase complex subunit  31.5 
 
 
209 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4187  carbon-phosphorus lyase complex subunit  32.43 
 
 
206 aa  60.1  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.908259  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3329  putative PhnH protein, phosphonate metabolism, function unknown  32.51 
 
 
203 aa  59.7  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0761  carbon-phosphorus lyase complex subunit  31.5 
 
 
200 aa  58.9  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4123  carbon-phosphorus lyase complex subunit  32.42 
 
 
202 aa  57.8  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1285  carbon-phosphorus lyase complex subunit  26.9 
 
 
203 aa  57.4  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.603279  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2279  phosphonate metabolism protein phnH  31.49 
 
 
180 aa  57  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1926  phosphonate C-P lyase system protein PhnH  31.49 
 
 
180 aa  57  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.50806  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0229  phosphonate C-P lyase system protein PhnH  26.5 
 
 
337 aa  55.5  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.202228  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4437  carbon-phosphorus lyase complex subunit  30.05 
 
 
202 aa  54.3  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0304  carbon-phosphorus lyase complex subunit  31.67 
 
 
194 aa  53.9  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.464076  normal  0.118863 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3826  carbon-phosphorus lyase complex subunit  27.83 
 
 
202 aa  53.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.441837  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2693  phosphonate C-P lyase system protein PhnH  28.28 
 
 
191 aa  51.6  0.000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2923  phosphonate C-P lyase system protein PhnH  30.6 
 
 
206 aa  52  0.000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.187632  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2180  carbon-phosphorus lyase complex subunit  28.49 
 
 
203 aa  51.6  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.120868 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0144  phosphonate metabolism  29.05 
 
 
199 aa  50.8  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.038132  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1590  hypothetical protein  27.69 
 
 
210 aa  50.4  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4234  carbon-phosphorus lyase complex subunit  27.23 
 
 
200 aa  48.9  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0769065  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4090  carbon-phosphorus lyase complex subunit  27.23 
 
 
204 aa  48.5  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.183624  normal  0.0413085 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3856  phosphonate C-P lyase system protein PhnH  36.26 
 
 
195 aa  47.8  0.00009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.905115 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5941  carbon-phosphorus lyase complex subunit  27.96 
 
 
207 aa  47.4  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2195  phosphonate metabolism  30.22 
 
 
209 aa  46.2  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0520  carbon-phosphorus lyase complex subunit  31.72 
 
 
193 aa  45.8  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.91344  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3511  phosphonate C-P lyase system protein PhnH  31.34 
 
 
208 aa  45.1  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0480  carbon-phosphorus lyase complex subunit  30.56 
 
 
193 aa  45.1  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0814  phosphonate C-P lyase system protein PhnH  27.22 
 
 
201 aa  45.1  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3774  carbon-phosphorus lyase complex subunit  24.87 
 
 
215 aa  44.7  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4208  phosphonate C-P lyase system protein PhnH  25.54 
 
 
196 aa  44.7  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5847  carbon-phosphorus lyase complex subunit  26.67 
 
 
203 aa  44.3  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.515972  normal  0.715691 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0576  carbon-phosphorus lyase complex subunit  25.77 
 
 
193 aa  43.9  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0269  hypothetical protein  27.22 
 
 
181 aa  43.9  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.709175  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0765  carbon-phosphorus lyase complex subunit  28.57 
 
 
205 aa  42.7  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.269741  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4781  carbon-phosphorus lyase complex subunit  29.94 
 
 
188 aa  42.4  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.259946  normal  0.333333 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>