71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2560 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2560  PhnH protein  100 
 
 		 198 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.37097  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2252  carbon-phosphorus lyase complex subunit  79.29 
 
 		 198 aa  305  3e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0116362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20370  carbon-phosphorus lyase complex subunit  61.54 
 
 		 209 aa  231  6e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.481874  normal  0.778261 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1750  carbon-phosphorus lyase complex subunit  61.66 
 
 		 209 aa  226  2e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.197013  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2885  carbon-phosphorus lyase complex subunit  60.62 
 
 		 203 aa  223  1e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0603135  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2693  phosphonate C-P lyase system protein PhnH  37.95 
 
 		 191 aa  127  8.000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0304  carbon-phosphorus lyase complex subunit  37.63 
 
 		 194 aa  122  3e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.464076  normal  0.118863 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4437  carbon-phosphorus lyase complex subunit  37.31 
 
 		 202 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0520  carbon-phosphorus lyase complex subunit  36.98 
 
 		 193 aa  119  3e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.91344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3826  carbon-phosphorus lyase complex subunit  37.24 
 
 		 202 aa  118  6e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.441837  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3891  phosphonate C-P lyase system protein PhnH  35.57 
 
 		 194 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03932  hypothetical protein  35.57 
 
 		 194 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03972  carbon-phosphorus lyase complex subunit  35.57 
 
 		 194 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4341  carbon-phosphorus lyase complex subunit  36.08 
 
 		 194 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3926  carbon-phosphorus lyase complex subunit  35.57 
 
 		 194 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5613  carbon-phosphorus lyase complex subunit  36.08 
 
 		 194 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4654  carbon-phosphorus lyase complex subunit  36.08 
 
 		 194 aa  116  3e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4090  carbon-phosphorus lyase complex subunit  36.5 
 
 		 204 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.183624  normal  0.0413085 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4566  carbon-phosphorus lyase complex subunit  34.54 
 
 		 194 aa  112  3e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0888  phosphonate C-P lyase system protein PhnH  38.14 
 
 		 191 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4187  carbon-phosphorus lyase complex subunit  41.67 
 
 		 206 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.908259  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3695  carbon-phosphorus lyase complex subunit  35.61 
 
 		 208 aa  108  4.0000000000000004e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.897186  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3561  carbon-phosphorus lyase complex subunit  35.61 
 
 		 208 aa  108  5e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5847  carbon-phosphorus lyase complex subunit  36.6 
 
 		 203 aa  108  5e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.515972  normal  0.715691 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4030  carbon-phosphorus lyase complex subunit  35.61 
 
 		 208 aa  108  5e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1285  carbon-phosphorus lyase complex subunit  37.81 
 
 		 203 aa  107  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.603279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4234  carbon-phosphorus lyase complex subunit  36.79 
 
 		 200 aa  106  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0769065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4123  carbon-phosphorus lyase complex subunit  34.72 
 
 		 202 aa  105  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4208  phosphonate C-P lyase system protein PhnH  39.29 
 
 		 196 aa  103  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2180  carbon-phosphorus lyase complex subunit  39.09 
 
 		 203 aa  103  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.120868 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3702  carbon-phosphorus lyase complex subunit  35.48 
 
 		 191 aa  103  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.318645 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3856  phosphonate C-P lyase system protein PhnH  39.59 
 
 		 195 aa  102  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.905115 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3774  carbon-phosphorus lyase complex subunit  38.54 
 
 		 215 aa  102  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0269  hypothetical protein  36.87 
 
 		 181 aa  102  4e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.709175  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0761  carbon-phosphorus lyase complex subunit  35.15 
 
 		 200 aa  102  4e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1309  phosphonate C-P lyase system protein PhnH  33.33 
 
 		 197 aa  102  4e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0225857  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0144  phosphonate metabolism  37.5 
 
 		 199 aa  102  5e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.038132  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4781  carbon-phosphorus lyase complex subunit  38.78 
 
 		 188 aa  100  9e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.259946  normal  0.333333 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0765  carbon-phosphorus lyase complex subunit  39.09 
 
 		 205 aa  99.4  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.269741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1178  carbon-phosphorus lyase complex subunit  36.5 
 
 		 209 aa  98.2  8e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3310  carbon-phosphorus lyase complex subunit  36.5 
 
 		 209 aa  98.2  8e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3355  carbon-phosphorus lyase complex subunit  36.5 
 
 		 207 aa  97.8  8e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2587  carbon-phosphorus lyase complex subunit  36.5 
 
 		 209 aa  98.2  8e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2279  phosphonate metabolism protein phnH  34.05 
 
 		 180 aa  96.7  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1926  phosphonate C-P lyase system protein PhnH  34.05 
 
 		 180 aa  96.7  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.50806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3344  carbon-phosphorus lyase complex subunit  36.36 
 
 		 209 aa  95.1  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.148755  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0317  carbon-phosphorus lyase complex subunit  36.36 
 
 		 209 aa  94.7  7e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2401  carbon-phosphorus lyase complex subunit  36.36 
 
 		 207 aa  94.7  7e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5941  carbon-phosphorus lyase complex subunit  36.36 
 
 		 207 aa  94  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2923  phosphonate C-P lyase system protein PhnH  36.73 
 
 		 206 aa  92  5e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.187632  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3329  putative PhnH protein, phosphonate metabolism, function unknown  31.84 
 
 		 203 aa  89.4  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0814  phosphonate C-P lyase system protein PhnH  32.29 
 
 		 201 aa  87.8  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0480  carbon-phosphorus lyase complex subunit  31.41 
 
 		 193 aa  85.9  4e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0576  carbon-phosphorus lyase complex subunit  31.41 
 
 		 193 aa  85.9  4e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2195  phosphonate metabolism  31.96 
 
 		 209 aa  85.5  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6097  phosphonate C-P lyase system protein PhnH  37.25 
 
 		 210 aa  85.5  5e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.965352  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1315  phosphonate metabolism  37.95 
 
 		 211 aa  81.3  0.000000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.205505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2912  phosphonate metabolism  34.87 
 
 		 187 aa  69.7  0.00000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4602  protein PhnH  40.23 
 
 		 97 aa  60.1  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3511  phosphonate C-P lyase system protein PhnH  32.82 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2913  phosphonate C-P lyase system protein PhnH  35.78 
 
 		 201 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1590  hypothetical protein  29.85 
 
 		 210 aa  52  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2958  phosphonate metabolism  29.36 
 
 		 235 aa  50.4  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0607553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0973  carbon-phosphorus lyase complex subunit  31.58 
 
 		 185 aa  47.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1002  carbon-phosphorus lyase complex subunit  31.58 
 
 		 185 aa  47.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2295  carbon-phosphorus lyase complex subunit  28.95 
 
 		 193 aa  47  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0218  carbon-phosphorus lyase complex subunit  27.87 
 
 		 192 aa  45.4  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4038  carbon-phosphorus lyase complex subunit  27.87 
 
 		 192 aa  45.4  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.724811  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3691  carbon-phosphorus lyase complex subunit  31.71 
 
 		 202 aa  45.1  0.0007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0229  phosphonate C-P lyase system protein PhnH  24.63 
 
 		 337 aa  44.7  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.202228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2083  carbon-phosphorus lyase complex subunit  26.25 
 
 		 202 aa  41.2  0.01  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>