58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E4602 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E4602  protein PhnH  100 
 
 		 97 aa  196  9e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4566  carbon-phosphorus lyase complex subunit  100 
 
 		 194 aa  184  4e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5613  carbon-phosphorus lyase complex subunit  95.65 
 
 		 194 aa  182  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4654  carbon-phosphorus lyase complex subunit  95.65 
 
 		 194 aa  181  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4341  carbon-phosphorus lyase complex subunit  93.48 
 
 		 194 aa  178  2e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3891  phosphonate C-P lyase system protein PhnH  93.48 
 
 		 194 aa  177  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03972  carbon-phosphorus lyase complex subunit  93.48 
 
 		 194 aa  177  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03932  hypothetical protein  93.48 
 
 		 194 aa  177  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3926  carbon-phosphorus lyase complex subunit  93.48 
 
 		 194 aa  177  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0304  carbon-phosphorus lyase complex subunit  81.52 
 
 		 194 aa  155  2e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.464076  normal  0.118863 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3695  carbon-phosphorus lyase complex subunit  58.82 
 
 		 208 aa  97.4  6e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.897186  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4030  carbon-phosphorus lyase complex subunit  58.82 
 
 		 208 aa  97.1  7e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3561  carbon-phosphorus lyase complex subunit  58.82 
 
 		 208 aa  97.1  7e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0888  phosphonate C-P lyase system protein PhnH  50 
 
 		 191 aa  89  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2693  phosphonate C-P lyase system protein PhnH  48.96 
 
 		 191 aa  88.6  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0520  carbon-phosphorus lyase complex subunit  47.13 
 
 		 193 aa  80.5  0.000000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.91344  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1309  phosphonate C-P lyase system protein PhnH  50.59 
 
 		 197 aa  79.3  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0225857  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4090  carbon-phosphorus lyase complex subunit  43.75 
 
 		 204 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.183624  normal  0.0413085 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0814  phosphonate C-P lyase system protein PhnH  39.39 
 
 		 201 aa  71.6  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3826  carbon-phosphorus lyase complex subunit  42.71 
 
 		 202 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.441837  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4437  carbon-phosphorus lyase complex subunit  41.11 
 
 		 202 aa  68.6  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4123  carbon-phosphorus lyase complex subunit  41.11 
 
 		 202 aa  65.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0761  carbon-phosphorus lyase complex subunit  38.54 
 
 		 200 aa  61.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3856  phosphonate C-P lyase system protein PhnH  42.71 
 
 		 195 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.905115 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3329  putative PhnH protein, phosphonate metabolism, function unknown  40 
 
 		 203 aa  61.2  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1285  carbon-phosphorus lyase complex subunit  37.5 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.603279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4234  carbon-phosphorus lyase complex subunit  39.08 
 
 		 200 aa  59.3  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0769065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5847  carbon-phosphorus lyase complex subunit  38.78 
 
 		 203 aa  58.2  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.515972  normal  0.715691 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1750  carbon-phosphorus lyase complex subunit  38.37 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.197013  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3774  carbon-phosphorus lyase complex subunit  40.38 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20370  carbon-phosphorus lyase complex subunit  38.37 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.481874  normal  0.778261 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4208  phosphonate C-P lyase system protein PhnH  39.8 
 
 		 196 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2885  carbon-phosphorus lyase complex subunit  37.21 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0603135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2180  carbon-phosphorus lyase complex subunit  40.4 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.120868 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2195  phosphonate metabolism  36.46 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2252  carbon-phosphorus lyase complex subunit  43.82 
 
 		 198 aa  53.9  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0116362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2587  carbon-phosphorus lyase complex subunit  36.67 
 
 		 209 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0317  carbon-phosphorus lyase complex subunit  36.67 
 
 		 209 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1178  carbon-phosphorus lyase complex subunit  36.67 
 
 		 209 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3355  carbon-phosphorus lyase complex subunit  36.67 
 
 		 207 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3310  carbon-phosphorus lyase complex subunit  36.67 
 
 		 209 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5941  carbon-phosphorus lyase complex subunit  35.71 
 
 		 207 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3344  carbon-phosphorus lyase complex subunit  36.67 
 
 		 209 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.148755  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2401  carbon-phosphorus lyase complex subunit  36.67 
 
 		 207 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4781  carbon-phosphorus lyase complex subunit  36.78 
 
 		 188 aa  51.6  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.259946  normal  0.333333 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1315  phosphonate metabolism  42.05 
 
 		 211 aa  50.8  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.205505  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2560  PhnH protein  40.23 
 
 		 198 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.37097  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0765  carbon-phosphorus lyase complex subunit  41.05 
 
 		 205 aa  48.9  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.269741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2279  phosphonate metabolism protein phnH  42.5 
 
 		 180 aa  47  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1926  phosphonate C-P lyase system protein PhnH  42.5 
 
 		 180 aa  47  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.50806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0144  phosphonate metabolism  33 
 
 		 199 aa  47  0.00009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.038132  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3702  carbon-phosphorus lyase complex subunit  35.23 
 
 		 191 aa  44.3  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.318645 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4187  carbon-phosphorus lyase complex subunit  45.12 
 
 		 206 aa  44.7  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.908259  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2913  phosphonate C-P lyase system protein PhnH  41.11 
 
 		 201 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0269  hypothetical protein  36.36 
 
 		 181 aa  43.9  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.709175  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6097  phosphonate C-P lyase system protein PhnH  35.16 
 
 		 210 aa  42.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.965352  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0480  carbon-phosphorus lyase complex subunit  35.05 
 
 		 193 aa  42.4  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0576  carbon-phosphorus lyase complex subunit  35.05 
 
 		 193 aa  42.7  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>