29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_2498 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_2879  hypothetical protein  100 
 
 		 254 aa  515  1.0000000000000001e-145  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.254922  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2498  hypothetical protein  100 
 
 		 254 aa  515  1.0000000000000001e-145  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0636  hypothetical protein  37.5 
 
 		 255 aa  140  1.9999999999999998e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1585  conserved hypothetical protein  36.08 
 
 		 253 aa  129  3e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.234564  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2214  hypothetical protein  36.08 
 
 		 253 aa  129  3e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1569  hypothetical protein  36.08 
 
 		 253 aa  129  3e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.977121  normal  0.449589 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2364  hypothetical protein  36.19 
 
 		 253 aa  126  3e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2367  hypothetical protein  32.3 
 
 		 254 aa  125  9e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.98108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2108  serine/threonine phosphoprotein phosphatase  33.46 
 
 		 276 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3009  hypothetical protein  34.78 
 
 		 253 aa  122  4e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.236321 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0385  serine/threonine phosphoprotein phosphatase  33.46 
 
 		 269 aa  121  9e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01977  hypothetical protein  35.04 
 
 		 253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01966  hypothetical protein  35.04 
 
 		 251 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1161  hypothetical protein  35.04 
 
 		 253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0988  hypothetical protein  36.4 
 
 		 226 aa  112  8.000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.244277 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3136  protein serine/threonine phosphatase  32.69 
 
 		 260 aa  110  3e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1104  hypothetical protein  35.41 
 
 		 260 aa  100  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0133  hypothetical protein  29.41 
 
 		 262 aa  96.3  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.748936  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0561  hypothetical protein  27.55 
 
 		 287 aa  90.9  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2726  hypothetical protein  30.65 
 
 		 258 aa  78.2  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0483  protein serine/threonine phosphatase  27.5 
 
 		 471 aa  63.5  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4763  hypothetical protein  27.85 
 
 		 260 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0811  hypothetical protein  25 
 
 		 293 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1173  hypothetical protein  29.35 
 
 		 470 aa  48.5  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3683  hypothetical protein  29.69 
 
 		 588 aa  48.1  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.941119  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1090  hypothetical protein  26.09 
 
 		 577 aa  46.6  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0504  hypothetical protein  26.09 
 
 		 577 aa  47  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0566  hypothetical protein  26.09 
 
 		 582 aa  46.6  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2990  hypothetical protein  27.15 
 
 		 445 aa  42.4  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.635935  normal  0.188009 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>