22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_0988 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_0988  hypothetical protein  100 
 
 		 226 aa  461  1e-129  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.244277 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1585  conserved hypothetical protein  94.25 
 
 		 253 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.234564  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1569  hypothetical protein  94.25 
 
 		 253 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.977121  normal  0.449589 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2364  hypothetical protein  94.64 
 
 		 253 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2214  hypothetical protein  94.25 
 
 		 253 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3009  hypothetical protein  92.41 
 
 		 253 aa  431  1e-120  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.236321 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01966  hypothetical protein  91.52 
 
 		 251 aa  422  1e-117  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1161  hypothetical protein  91.52 
 
 		 253 aa  422  1e-117  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01977  hypothetical protein  91.52 
 
 		 253 aa  422  1e-117  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0636  hypothetical protein  37.44 
 
 		 255 aa  125  6e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3136  protein serine/threonine phosphatase  36.87 
 
 		 260 aa  114  1.0000000000000001e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2498  hypothetical protein  36.4 
 
 		 254 aa  112  7.000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2879  hypothetical protein  36.4 
 
 		 254 aa  112  7.000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.254922  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2367  hypothetical protein  34.86 
 
 		 254 aa  111  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.98108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0385  serine/threonine phosphoprotein phosphatase  34.39 
 
 		 269 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2108  serine/threonine phosphoprotein phosphatase  32.26 
 
 		 276 aa  109  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0133  hypothetical protein  33.63 
 
 		 262 aa  106  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.748936  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1104  hypothetical protein  35.82 
 
 		 260 aa  92.8  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0561  hypothetical protein  28.51 
 
 		 287 aa  92.4  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2726  hypothetical protein  30.57 
 
 		 258 aa  67.8  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4763  hypothetical protein  29.86 
 
 		 260 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0483  protein serine/threonine phosphatase  23.01 
 
 		 471 aa  46.2  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>