29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_4763 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4763  hypothetical protein  100 
 
 		 260 aa  535  1e-151  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0133  hypothetical protein  28.02 
 
 		 262 aa  85.5  8e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.748936  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0636  hypothetical protein  30.9 
 
 		 255 aa  71.2  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2726  hypothetical protein  29.06 
 
 		 258 aa  68.6  0.00000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3136  protein serine/threonine phosphatase  27.84 
 
 		 260 aa  66.2  0.0000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0561  hypothetical protein  25.3 
 
 		 287 aa  66.2  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01966  hypothetical protein  28.57 
 
 		 251 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1161  hypothetical protein  28.57 
 
 		 253 aa  64.3  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01977  hypothetical protein  28.57 
 
 		 253 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0385  serine/threonine phosphoprotein phosphatase  27.18 
 
 		 269 aa  63.5  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1569  hypothetical protein  29.21 
 
 		 253 aa  63.2  0.000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.977121  normal  0.449589 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3009  hypothetical protein  27.93 
 
 		 253 aa  63.2  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.236321 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1585  conserved hypothetical protein  29.21 
 
 		 253 aa  63.2  0.000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.234564  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2214  hypothetical protein  29.21 
 
 		 253 aa  63.2  0.000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0483  protein serine/threonine phosphatase  27.48 
 
 		 471 aa  61.6  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2364  hypothetical protein  28.65 
 
 		 253 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2498  hypothetical protein  27.85 
 
 		 254 aa  61.2  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2879  hypothetical protein  27.85 
 
 		 254 aa  61.2  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.254922  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1104  hypothetical protein  31.66 
 
 		 260 aa  61.6  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2108  serine/threonine phosphoprotein phosphatase  26.6 
 
 		 276 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1173  hypothetical protein  27.91 
 
 		 470 aa  60.8  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2367  hypothetical protein  28.35 
 
 		 254 aa  56.6  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.98108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13610  hypothetical protein  25.13 
 
 		 366 aa  48.5  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0988  hypothetical protein  29.86 
 
 		 226 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.244277 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0811  hypothetical protein  26.01 
 
 		 293 aa  46.2  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2990  hypothetical protein  22.06 
 
 		 445 aa  44.3  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.635935  normal  0.188009 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3683  hypothetical protein  24.02 
 
 		 588 aa  44.3  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.941119  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4196  hypothetical protein  25.25 
 
 		 238 aa  43.9  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0289513 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1750  protein phosphatase 2C domain-containing protein  26.13 
 
 		 247 aa  42.7  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165871  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>