21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1173 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1173  hypothetical protein  100 
 
 		 470 aa  973    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0504  hypothetical protein  34.5 
 
 		 577 aa  236  5.0000000000000005e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0566  hypothetical protein  34.5 
 
 		 582 aa  236  5.0000000000000005e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1090  hypothetical protein  34.5 
 
 		 577 aa  236  9e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4665  hypothetical protein  36.44 
 
 		 576 aa  227  4e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.609083  normal  0.0906137 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3683  hypothetical protein  35.6 
 
 		 588 aa  223  4e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.941119  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0631  hypothetical protein  31.53 
 
 		 516 aa  197  4.0000000000000005e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2990  hypothetical protein  31.41 
 
 		 445 aa  150  4e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.635935  normal  0.188009 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0483  protein serine/threonine phosphatase  27.75 
 
 		 471 aa  65.9  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0133  hypothetical protein  29.32 
 
 		 262 aa  61.6  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.748936  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4763  hypothetical protein  27.91 
 
 		 260 aa  60.8  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3136  protein serine/threonine phosphatase  25.81 
 
 		 260 aa  55.5  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2108  serine/threonine phosphoprotein phosphatase  26.32 
 
 		 276 aa  50.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2498  hypothetical protein  29.35 
 
 		 254 aa  48.5  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2879  hypothetical protein  29.35 
 
 		 254 aa  48.5  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.254922  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7175  protein serine/threonine phosphatase  24.3 
 
 		 340 aa  46.6  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0194561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0636  hypothetical protein  25.78 
 
 		 255 aa  46.6  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2367  hypothetical protein  25.2 
 
 		 254 aa  45.8  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.98108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0385  serine/threonine phosphoprotein phosphatase  22.91 
 
 		 269 aa  44.7  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0561  hypothetical protein  25 
 
 		 287 aa  43.5  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1104  hypothetical protein  30.12 
 
 		 260 aa  43.1  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>