12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_0566 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_0504  hypothetical protein  98.8 
 
 		 577 aa  1178    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1090  hypothetical protein  96.74 
 
 		 577 aa  1152    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0566  hypothetical protein  100 
 
 		 582 aa  1199    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3683  hypothetical protein  51.43 
 
 		 588 aa  594  1e-168  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.941119  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4665  hypothetical protein  41.98 
 
 		 576 aa  383  1e-105  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.609083  normal  0.0906137 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1173  hypothetical protein  34.5 
 
 		 470 aa  236  6e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0631  hypothetical protein  34.35 
 
 		 516 aa  181  2e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2990  hypothetical protein  34.01 
 
 		 445 aa  134  5e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.635935  normal  0.188009 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0483  protein serine/threonine phosphatase  25.59 
 
 		 471 aa  50.4  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0133  hypothetical protein  31.03 
 
 		 262 aa  48.1  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.748936  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2498  hypothetical protein  26.09 
 
 		 254 aa  46.6  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2879  hypothetical protein  26.09 
 
 		 254 aa  46.6  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.254922  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>