22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_01977 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_01977  hypothetical protein  100 
 
 
253 aa  517  1e-146  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1161  hypothetical protein  100 
 
 
253 aa  517  1e-146  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01966  hypothetical protein  100 
 
 
251 aa  513  1e-144  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2364  hypothetical protein  94.47 
 
 
253 aa  494  1e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3009  hypothetical protein  93.28 
 
 
253 aa  490  9.999999999999999e-139  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.236321 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1585  conserved hypothetical protein  92.83 
 
 
253 aa  480  1e-134  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.234564  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1569  hypothetical protein  92.83 
 
 
253 aa  480  1e-134  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.977121  normal  0.449589 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2214  hypothetical protein  92.83 
 
 
253 aa  480  1e-134  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0988  hypothetical protein  91.52 
 
 
226 aa  422  1e-117  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.244277 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0636  hypothetical protein  33.85 
 
 
255 aa  144  2e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0385  serine/threonine phosphoprotein phosphatase  34.88 
 
 
269 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2108  serine/threonine phosphoprotein phosphatase  33.33 
 
 
276 aa  135  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3136  protein serine/threonine phosphatase  36.76 
 
 
260 aa  131  1.0000000000000001e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2367  hypothetical protein  34.24 
 
 
254 aa  124  1e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.98108  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2498  hypothetical protein  35.04 
 
 
254 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2879  hypothetical protein  35.04 
 
 
254 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.254922  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0133  hypothetical protein  32.09 
 
 
262 aa  118  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.748936  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0561  hypothetical protein  29.66 
 
 
287 aa  116  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1104  hypothetical protein  36.25 
 
 
260 aa  102  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2726  hypothetical protein  28.74 
 
 
258 aa  81.3  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4763  hypothetical protein  28.57 
 
 
260 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0483  protein serine/threonine phosphatase  23.74 
 
 
471 aa  59.7  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>