43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1713 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_2054  hypothetical protein  100 
 
 		 260 aa  542  1e-153  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.933318  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1713  Putative salt-induced outer membrane protein-like protein  100 
 
 		 260 aa  542  1e-153  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0964751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1079  protein of unknown function DUF481  26.18 
 
 		 249 aa  77.4  0.0000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2309  protein of unknown function DUF481  25.51 
 
 		 244 aa  73.9  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.070466 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2791  hypothetical protein  25.23 
 
 		 245 aa  72.8  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00000611146  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3223  hypothetical protein  27.8 
 
 		 255 aa  64.7  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3360  hypothetical protein  27.8 
 
 		 255 aa  64.7  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.853104  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0606  hypothetical protein  27.19 
 
 		 250 aa  63.9  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3855  hypothetical protein  24.66 
 
 		 305 aa  64.7  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.248641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0878  hypothetical protein  29.8 
 
 		 254 aa  55.5  0.0000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.428575  normal  0.136015 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2051  hypothetical protein  20.58 
 
 		 248 aa  54.7  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000194447  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0831  hypothetical protein  23.68 
 
 		 245 aa  54.7  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.221265  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3461  protein of unknown function DUF481  23.68 
 
 		 245 aa  54.7  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3655  hypothetical protein  23.68 
 
 		 245 aa  54.3  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3536  hypothetical protein  23.25 
 
 		 245 aa  53.1  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1424  putative outer membrane protein  26.44 
 
 		 241 aa  50.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.284815  decreased coverage  0.000282683 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1456  hypothetical protein  26.44 
 
 		 241 aa  50.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.273825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1441  hypothetical protein  26.44 
 
 		 241 aa  50.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0990956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2754  hypothetical protein  22.07 
 
 		 247 aa  50.4  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.716555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1722  hypothetical protein  22.66 
 
 		 289 aa  50.4  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.281842  normal  0.346331 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1844  putative outer membrane protein  25.84 
 
 		 241 aa  50.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000476612  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01679  hypothetical protein  23.9 
 
 		 252 aa  49.7  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1920  protein of unknown function DUF481  23.9 
 
 		 252 aa  49.7  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.302148  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01691  hypothetical protein  23.9 
 
 		 252 aa  49.7  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0876  hypothetical protein  22.69 
 
 		 245 aa  50.1  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0538553  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3877  hypothetical protein  24.58 
 
 		 294 aa  49.7  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1803  hypothetical protein  23.41 
 
 		 252 aa  48.9  0.00008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000450339  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2440  hypothetical protein  23.41 
 
 		 252 aa  48.9  0.00008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.350144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1967  hypothetical protein  23.41 
 
 		 252 aa  48.9  0.00008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1469  hypothetical protein  23.41 
 
 		 252 aa  48.9  0.00008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0334595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1910  hypothetical protein  23.41 
 
 		 252 aa  48.9  0.00008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.155146  normal  0.390099 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1941  hypothetical protein  23.41 
 
 		 252 aa  48.9  0.00008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00616425  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2017  putative outer membrane protein  25.96 
 
 		 241 aa  48.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.277986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2903  hypothetical protein  26.24 
 
 		 229 aa  47.8  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00154459  normal  0.305825 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3011  hypothetical protein  23.23 
 
 		 243 aa  47  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.809018  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0652  hypothetical protein  21.05 
 
 		 246 aa  47  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000000354938  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0934  hypothetical protein  23.58 
 
 		 245 aa  46.6  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3349  hypothetical protein  21.93 
 
 		 245 aa  46.2  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000236372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1087  hypothetical protein  20.45 
 
 		 246 aa  45.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000312385  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3246  hypothetical protein  21.49 
 
 		 245 aa  44.3  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0192004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0777  hypothetical protein  21.49 
 
 		 245 aa  44.3  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0484485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3358  hypothetical protein  20.9 
 
 		 245 aa  43.5  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000013403  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1569  hypothetical protein  19.7 
 
 		 251 aa  42.7  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000191147 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>