44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_0325 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_0325  putative integrase  100 
 
 		 175 aa  353  7.999999999999999e-97  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0523813 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0670  putative integrase  100 
 
 		 175 aa  353  7.999999999999999e-97  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0510  transposase, degenerate  100 
 
 		 175 aa  353  7.999999999999999e-97  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.252623  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0836  transposase, degenerate  100 
 
 		 175 aa  353  7.999999999999999e-97  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0710  putative integrase  62.86 
 
 		 478 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.112967 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1122  putative transposase protein  62.86 
 
 		 478 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5181  Integrase catalytic region  62.29 
 
 		 478 aa  210  5.999999999999999e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6466  Integrase catalytic region  62.29 
 
 		 478 aa  210  5.999999999999999e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000892643 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6582  Integrase catalytic region  62.29 
 
 		 478 aa  210  5.999999999999999e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0318996 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7260  Integrase catalytic region  62.29 
 
 		 478 aa  210  5.999999999999999e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0099  Integrase catalytic region  62.29 
 
 		 478 aa  210  5.999999999999999e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0130  Integrase catalytic region  62.29 
 
 		 478 aa  210  5.999999999999999e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4424  transposase Tn6049  55.03 
 
 		 479 aa  160  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0079465  normal  0.207444 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5480  transposase Tn6049  55.03 
 
 		 479 aa  160  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.41731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3931  transposase Tn6049  55.03 
 
 		 479 aa  160  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0145396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3142  integrase catalytic subunit  55.03 
 
 		 479 aa  160  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.943926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2837  integrase catalytic subunit  55.03 
 
 		 479 aa  160  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2552  integrase catalytic subunit  55.03 
 
 		 479 aa  160  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.338431  normal  0.288762 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2405  integrase catalytic subunit  55.03 
 
 		 479 aa  160  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000242595  decreased coverage  0.0000044189 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2008  integrase catalytic subunit  55.03 
 
 		 479 aa  160  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.160475  normal  0.110252 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2000  integrase catalytic subunit  55.03 
 
 		 479 aa  160  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0911973 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0321  integrase catalytic subunit  55.03 
 
 		 479 aa  160  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.549324 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6335  transposase Tn6049  55.03 
 
 		 479 aa  160  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000710666  hitchhiker  0.00105142 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6374  transposase Tn6049  55.03 
 
 		 479 aa  160  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.038009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2273  integrase catalytic subunit  46.86 
 
 		 484 aa  148  3e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2125  integrase catalytic subunit  46.86 
 
 		 484 aa  148  3e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1330  integrase catalytic subunit  46.86 
 
 		 484 aa  148  3e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.052646  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1322  integrase catalytic subunit  46.86 
 
 		 484 aa  148  3e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0942  integrase catalytic subunit  46.86 
 
 		 484 aa  148  3e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0458  integrase catalytic subunit  46.86 
 
 		 484 aa  148  3e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2853  integrase catalytic subunit  46.86 
 
 		 462 aa  148  4e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2396  hypothetical protein  97.44 
 
 		 59 aa  81.6  0.000000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12826  transposase  41.58 
 
 		 469 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.44117e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0544  integrase catalytic subunit  27.38 
 
 		 441 aa  50.8  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.265235  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1107  integrase catalytic subunit  27.38 
 
 		 441 aa  50.8  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.515553  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1874  integrase catalytic subunit  27.38 
 
 		 441 aa  50.8  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0381  integrase catalytic subunit  27.38 
 
 		 441 aa  50.8  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4946  Integrase catalytic region  35.53 
 
 		 489 aa  43.1  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4520  Integrase catalytic region  35.9 
 
 		 493 aa  43.5  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1285  Integrase catalytic region  35.9 
 
 		 493 aa  43.5  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.543739  normal  0.626135 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5572  integrase catalytic subunit  30.89 
 
 		 510 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.588721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0312  Integrase catalytic region  28.26 
 
 		 416 aa  41.6  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5446  integrase catalytic subunit  28.67 
 
 		 522 aa  40.8  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.517222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3744  Integrase catalytic region  35.9 
 
 		 495 aa  40.8  0.01  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0190412  normal  0.14129 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>