15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2308 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2308  protein of unknown function DUF637 hemagglutinin putative  100 
 
 		 637 aa  1294    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0370  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  29.83 
 
 		 2421 aa  111  5e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0363  protein of unknown function DUF637 hemagglutinin putative  29.01 
 
 		 557 aa  105  3e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0366  protein of unknown function DUF637 hemagglutinin putative  29.01 
 
 		 1571 aa  103  7e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2787  filamentous haemagglutinin  29.35 
 
 		 980 aa  99.4  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2777  filamentous hemagglutinin  29.35 
 
 		 3563 aa  98.2  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00510  putative hemagglutinin  30.06 
 
 		 3443 aa  97.8  6e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.443452 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3210  filamentous hemagglutinin family protein  30.25 
 
 		 991 aa  87.4  8e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.379337  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32790  hypothetical protein  28.16 
 
 		 5212 aa  86.7  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000189329 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0044  filamentous hemagglutinin  28.96 
 
 		 2904 aa  70.1  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0065  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  28.73 
 
 		 1723 aa  67  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.290227  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3229  filamentous hemagglutinin, intein-containing, putative  28.9 
 
 		 6274 aa  64.7  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1481  hypothetical protein  29.34 
 
 		 1275 aa  56.6  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3151  adhesin  38.98 
 
 		 2758 aa  53.1  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2001  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  31.55 
 
 		 3862 aa  51.2  0.00005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>