41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2073 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2073  cellulose synthase operon protein YhjU  100 
 
 		 529 aa  1063    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000289542 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3520  hypothetical protein  38.61 
 
 		 522 aa  348  1e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0949443  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1168  hypothetical protein  33.84 
 
 		 514 aa  339  8e-92  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.710032  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3200  hypothetical protein  39.39 
 
 		 537 aa  336  7.999999999999999e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.33903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2133  hypothetical protein  39.2 
 
 		 537 aa  332  1e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.814826  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2632  hypothetical protein  39.44 
 
 		 537 aa  331  2e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.346191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0143  hypothetical protein  37.24 
 
 		 550 aa  328  2.0000000000000001e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0937  membrane protein  35 
 
 		 541 aa  323  5e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.303935  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0798  hypothetical protein  39.2 
 
 		 521 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.123535  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0081  cellulose synthase operon protein YhjU  36.13 
 
 		 553 aa  318  1e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0078  cellulose synthase operon protein YhjU  35.57 
 
 		 552 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3819  cellulose synthase operon protein YhjU  35.67 
 
 		 559 aa  312  9e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0552389  normal  0.251037 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4001  endoglucanase BcsG  35.67 
 
 		 559 aa  311  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3941  cellulose synthase operon protein YhjU  35.67 
 
 		 559 aa  311  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3897  cellulose synthase operon protein YhjU  35.67 
 
 		 559 aa  311  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3833  cellulose synthase operon protein YhjU  35.67 
 
 		 559 aa  311  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3935  hypothetical protein  35.12 
 
 		 559 aa  309  9e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0965348 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2257  hypothetical protein  38.56 
 
 		 520 aa  308  1.0000000000000001e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.293956 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03339  hypothetical protein  35.54 
 
 		 559 aa  307  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.821846  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0175  cellulose synthase operon protein YhjU  35.54 
 
 		 559 aa  307  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03386  predicted inner membrane protein  35.54 
 
 		 559 aa  307  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4026  hypothetical protein  35.36 
 
 		 559 aa  307  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4904  hypothetical protein  35.36 
 
 		 559 aa  307  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0178  hypothetical protein  35.36 
 
 		 559 aa  306  5.0000000000000004e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3847  hypothetical protein  35.17 
 
 		 559 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1584  hypothetical protein  38.35 
 
 		 518 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0611442  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0692  hypothetical protein  38.35 
 
 		 518 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.231453  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2014  hypothetical protein  38.35 
 
 		 518 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2225  hypothetical protein  38.35 
 
 		 518 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1364  cellulose synthase operon protein YhjU  37.88 
 
 		 518 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0972818 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1386  hypothetical protein  37.69 
 
 		 518 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0904  hypothetical protein  37.69 
 
 		 518 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1298  hypothetical protein  36.9 
 
 		 516 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.422934  normal  0.0680644 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1920  hypothetical protein  37.92 
 
 		 518 aa  302  1e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.424583 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1264  hypothetical protein  37.24 
 
 		 517 aa  297  3e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0625  hypothetical protein  37.97 
 
 		 518 aa  297  3e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0508339  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4531  hypothetical protein  37.9 
 
 		 518 aa  297  4e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.179546 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2139  hypothetical protein  38.23 
 
 		 518 aa  293  6e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3996  hypothetical protein  36.15 
 
 		 442 aa  250  4e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3733  hypothetical protein  38.2 
 
 		 188 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3998  hypothetical protein  39.39 
 
 		 120 aa  65.5  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.256324  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>