24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E3998 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011353  ECH74115_4904  hypothetical protein  100 
 
 		 559 aa  251  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4026  hypothetical protein  100 
 
 		 559 aa  251  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3847  hypothetical protein  100 
 
 		 559 aa  251  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0175  cellulose synthase operon protein YhjU  99.17 
 
 		 559 aa  250  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03386  predicted inner membrane protein  99.17 
 
 		 559 aa  250  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03339  hypothetical protein  99.17 
 
 		 559 aa  250  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.821846  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0178  hypothetical protein  98.33 
 
 		 559 aa  249  1e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3998  hypothetical protein  100 
 
 		 120 aa  244  4e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.256324  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4001  endoglucanase BcsG  85 
 
 		 559 aa  221  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3833  cellulose synthase operon protein YhjU  85 
 
 		 559 aa  221  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3819  cellulose synthase operon protein YhjU  85 
 
 		 559 aa  222  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0552389  normal  0.251037 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3897  cellulose synthase operon protein YhjU  85 
 
 		 559 aa  221  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3941  cellulose synthase operon protein YhjU  85 
 
 		 559 aa  221  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3935  hypothetical protein  84.17 
 
 		 559 aa  212  9.999999999999999e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0965348 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0143  hypothetical protein  70.69 
 
 		 550 aa  174  3e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0078  cellulose synthase operon protein YhjU  72.9 
 
 		 552 aa  170  6.999999999999999e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0081  cellulose synthase operon protein YhjU  72.22 
 
 		 553 aa  169  7.999999999999999e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2133  hypothetical protein  48.25 
 
 		 537 aa  100  7e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.814826  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2632  hypothetical protein  48.25 
 
 		 537 aa  100  7e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.346191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3200  hypothetical protein  46.85 
 
 		 537 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.33903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1168  hypothetical protein  40.62 
 
 		 514 aa  82  0.000000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.710032  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0937  membrane protein  41 
 
 		 541 aa  76.3  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.303935  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2073  cellulose synthase operon protein YhjU  39.39 
 
 		 529 aa  65.5  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000289542 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3520  hypothetical protein  35.42 
 
 		 522 aa  50.8  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0949443  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>