39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1358 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_1358  adaptor protein  100 
 
 
217 aa  444  1.0000000000000001e-124  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00058732  normal  0.0135974 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0568  adaptor protein  41.41 
 
 
223 aa  143  2e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1703  adaptor protein  31.95 
 
 
235 aa  124  8.000000000000001e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.732057  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1162  negative regulator of genetic competence, sporulation and motility  41.38 
 
 
241 aa  77.8  0.0000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0765  adaptor protein  26.52 
 
 
228 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1976  negative regulator of genetic competence, sporulation and motility  24.15 
 
 
233 aa  59.7  0.00000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.724291  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1620  adaptor protein  21.46 
 
 
226 aa  58.5  0.00000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0578  adaptor protein  24.28 
 
 
240 aa  58.2  0.00000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.210236  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1016  adaptor protein  22.31 
 
 
239 aa  58.2  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000556878  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2566  Negative regulator of genetic competence  25.9 
 
 
204 aa  57.4  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1584  adaptor protein  23.39 
 
 
202 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.3725299999999996e-31 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1651  adaptor protein  23.39 
 
 
202 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000117003  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0997  adaptor protein  22.31 
 
 
239 aa  58.2  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0891253  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1510  adaptor protein  23.39 
 
 
202 aa  57.8  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000470165  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1616  adaptor protein  23.39 
 
 
202 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000116418  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1372  adaptor protein  23.39 
 
 
202 aa  57.8  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000504302  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1400  adaptor protein  23.39 
 
 
202 aa  57.8  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0457533  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1371  adaptor protein  23.39 
 
 
202 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000125272  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1545  adaptor protein  23.85 
 
 
202 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00170142  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1213  adaptor protein  23.39 
 
 
200 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000472996  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3800  adaptor protein  23.39 
 
 
202 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000607064  hitchhiker  0.000000000000878856 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1412  adaptor protein  23.85 
 
 
202 aa  56.2  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000280861  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0139  adaptor protein  23.11 
 
 
251 aa  55.5  0.0000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4102  Negative regulator of genetic competence  23.66 
 
 
193 aa  52  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000186936  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0216  adaptor protein  27.27 
 
 
249 aa  51.2  0.00001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0906  adaptor protein  20.61 
 
 
224 aa  46.2  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1311  adaptor protein  19.65 
 
 
227 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.425461  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1111  adaptor protein  19.65 
 
 
227 aa  44.3  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1273  adaptor protein  19.65 
 
 
227 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4097  adaptor protein  19.65 
 
 
227 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1349  adaptor protein  19.65 
 
 
227 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.281114  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0564  negative regulator of genetic competence sporulation and motility-like protein  34.38 
 
 
265 aa  44.7  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1093  adaptor protein  19.65 
 
 
227 aa  44.7  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1087  adaptor protein  19.65 
 
 
227 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.730074  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0085  negative regulator of genetic competence  20.43 
 
 
210 aa  44.7  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1244  adaptor protein  19.65 
 
 
227 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2184  adaptor protein  20.98 
 
 
196 aa  42.4  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0186536  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1712  Negative regulator of genetic competence  24.69 
 
 
204 aa  42.4  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.103848  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0444  adaptor protein  20.55 
 
 
196 aa  42  0.007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>