38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1976 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_1976  negative regulator of genetic competence, sporulation and motility  100 
 
 		 233 aa  476  1e-133  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.724291  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0216  adaptor protein  28.05 
 
 		 249 aa  92  7e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0139  adaptor protein  27.09 
 
 		 251 aa  84  0.000000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0568  adaptor protein  23.4 
 
 		 223 aa  75.5  0.0000000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1703  adaptor protein  21.46 
 
 		 235 aa  72  0.000000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.732057  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1620  adaptor protein  23.18 
 
 		 226 aa  68.9  0.00000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4102  Negative regulator of genetic competence  25.97 
 
 		 193 aa  67  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000186936  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0765  adaptor protein  20.94 
 
 		 228 aa  64.3  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0906  adaptor protein  23.71 
 
 		 224 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1358  adaptor protein  24.15 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00058732  normal  0.0135974 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4097  adaptor protein  22.41 
 
 		 227 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1087  adaptor protein  22.08 
 
 		 227 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.730074  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1244  adaptor protein  22.41 
 
 		 227 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1273  adaptor protein  22.41 
 
 		 227 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1349  adaptor protein  22.08 
 
 		 227 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.281114  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1111  adaptor protein  22.08 
 
 		 227 aa  57  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1311  adaptor protein  22.08 
 
 		 227 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.425461  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1093  adaptor protein  22.41 
 
 		 227 aa  56.6  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1099  adaptor protein  22.41 
 
 		 227 aa  56.2  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0085  negative regulator of genetic competence  26.38 
 
 		 210 aa  55.1  0.0000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1162  negative regulator of genetic competence, sporulation and motility  34.78 
 
 		 241 aa  55.1  0.000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0578  adaptor protein  22.13 
 
 		 240 aa  54.3  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.210236  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0564  negative regulator of genetic competence sporulation and motility-like protein  19.71 
 
 		 265 aa  51.2  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1016  adaptor protein  19.01 
 
 		 239 aa  50.4  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000556878  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0997  adaptor protein  19.01 
 
 		 239 aa  50.4  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0891253  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0444  adaptor protein  24.36 
 
 		 196 aa  50.4  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1712  Negative regulator of genetic competence  20.68 
 
 		 204 aa  49.7  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.103848  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2184  adaptor protein  24.36 
 
 		 196 aa  48.5  0.00009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0186536  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1203  adaptor protein  20.81 
 
 		 217 aa  48.5  0.00009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.10671  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1213  adaptor protein  24.57 
 
 		 200 aa  47  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000472996  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1651  adaptor protein  24.36 
 
 		 202 aa  45.4  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000117003  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1584  adaptor protein  24.36 
 
 		 202 aa  45.4  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.3725299999999996e-31 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1616  adaptor protein  24.36 
 
 		 202 aa  45.4  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000116418  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1400  adaptor protein  24.36 
 
 		 202 aa  45.4  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0457533  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1510  adaptor protein  24.36 
 
 		 202 aa  45.4  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000470165  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1372  adaptor protein  24.36 
 
 		 202 aa  45.4  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000504302  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1371  adaptor protein  24.36 
 
 		 202 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000125272  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1412  adaptor protein  22.51 
 
 		 202 aa  43.9  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000280861  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>