38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2184 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_2184  adaptor protein  100 
 
 
196 aa  402  1e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0186536  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0444  adaptor protein  92.23 
 
 
196 aa  372  1e-102  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1412  adaptor protein  62.05 
 
 
202 aa  247  1e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000280861  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1213  adaptor protein  59.18 
 
 
200 aa  245  3e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000472996  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1545  adaptor protein  61.54 
 
 
202 aa  244  8e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00170142  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3800  adaptor protein  60.51 
 
 
202 aa  243  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000607064  hitchhiker  0.000000000000878856 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1400  adaptor protein  60.51 
 
 
202 aa  239  2e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0457533  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1372  adaptor protein  60.51 
 
 
202 aa  239  2e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000504302  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1584  adaptor protein  60.51 
 
 
202 aa  239  2e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.3725299999999996e-31 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1510  adaptor protein  60.51 
 
 
202 aa  239  2e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000470165  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1651  adaptor protein  60.51 
 
 
202 aa  239  2e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000117003  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1616  adaptor protein  60.51 
 
 
202 aa  239  2e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000116418  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1371  adaptor protein  60.51 
 
 
202 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000125272  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1712  Negative regulator of genetic competence  31.25 
 
 
204 aa  105  3e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.103848  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0906  adaptor protein  30.97 
 
 
224 aa  103  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4097  adaptor protein  28.95 
 
 
227 aa  99.4  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1244  adaptor protein  28.51 
 
 
227 aa  97.1  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1273  adaptor protein  28.51 
 
 
227 aa  96.7  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1349  adaptor protein  28.51 
 
 
227 aa  96.7  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.281114  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1311  adaptor protein  28.51 
 
 
227 aa  96.7  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.425461  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1111  adaptor protein  28.51 
 
 
227 aa  96.7  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1093  adaptor protein  28.51 
 
 
227 aa  96.7  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1087  adaptor protein  28.51 
 
 
227 aa  96.7  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.730074  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1099  adaptor protein  28.51 
 
 
227 aa  95.9  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0765  adaptor protein  28.26 
 
 
228 aa  94.4  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1203  adaptor protein  28.44 
 
 
217 aa  90.1  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.10671  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0085  negative regulator of genetic competence  27.88 
 
 
210 aa  89.4  4e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1620  adaptor protein  25.66 
 
 
226 aa  89.4  4e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0997  adaptor protein  27.2 
 
 
239 aa  76.3  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0891253  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1016  adaptor protein  27.2 
 
 
239 aa  76.3  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000556878  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2566  Negative regulator of genetic competence  26.47 
 
 
204 aa  72  0.000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0578  adaptor protein  24.68 
 
 
240 aa  69.7  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.210236  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4102  Negative regulator of genetic competence  22.56 
 
 
193 aa  66.2  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000186936  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0568  adaptor protein  23.56 
 
 
223 aa  60.8  0.00000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3752  negative regulator of genetic competence sporulation and motility-like protein  31.87 
 
 
261 aa  56.2  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000704019  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1976  negative regulator of genetic competence, sporulation and motility  24.36 
 
 
233 aa  48.5  0.00006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.724291  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1703  adaptor protein  21.16 
 
 
235 aa  48.1  0.00007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.732057  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1358  adaptor protein  20.98 
 
 
217 aa  42.4  0.004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00058732  normal  0.0135974 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>