38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0444 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0444  adaptor protein  100 
 
 
196 aa  402  1e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2184  adaptor protein  92.23 
 
 
196 aa  372  1e-102  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0186536  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1213  adaptor protein  61.14 
 
 
200 aa  246  1e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000472996  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1412  adaptor protein  62.05 
 
 
202 aa  244  8e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000280861  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1545  adaptor protein  61.54 
 
 
202 aa  241  7e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00170142  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1400  adaptor protein  61.03 
 
 
202 aa  239  2e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0457533  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1372  adaptor protein  61.03 
 
 
202 aa  239  2e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000504302  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1584  adaptor protein  61.03 
 
 
202 aa  239  2e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.3725299999999996e-31 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1616  adaptor protein  61.03 
 
 
202 aa  239  2e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000116418  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1510  adaptor protein  61.03 
 
 
202 aa  239  2e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000470165  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1651  adaptor protein  61.03 
 
 
202 aa  239  2e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000117003  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3800  adaptor protein  60.51 
 
 
202 aa  239  2e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000607064  hitchhiker  0.000000000000878856 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1371  adaptor protein  61.03 
 
 
202 aa  238  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000125272  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1712  Negative regulator of genetic competence  32.04 
 
 
204 aa  109  3e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.103848  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0906  adaptor protein  29.2 
 
 
224 aa  96.7  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4097  adaptor protein  28.38 
 
 
227 aa  92.8  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0085  negative regulator of genetic competence  28.37 
 
 
210 aa  92.4  4e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1244  adaptor protein  28.38 
 
 
227 aa  92.4  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1349  adaptor protein  28.38 
 
 
227 aa  92  5e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.281114  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1273  adaptor protein  28.38 
 
 
227 aa  92  5e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1311  adaptor protein  28.38 
 
 
227 aa  92  5e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.425461  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1111  adaptor protein  28.38 
 
 
227 aa  92  5e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1093  adaptor protein  28.38 
 
 
227 aa  92  5e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1087  adaptor protein  28.38 
 
 
227 aa  92  5e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.730074  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1099  adaptor protein  28.32 
 
 
227 aa  90.9  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0765  adaptor protein  29.39 
 
 
228 aa  89  4e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1203  adaptor protein  28.31 
 
 
217 aa  85.5  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.10671  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1620  adaptor protein  25.88 
 
 
226 aa  85.9  4e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4102  Negative regulator of genetic competence  23.59 
 
 
193 aa  71.6  0.000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000186936  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2566  Negative regulator of genetic competence  25.85 
 
 
204 aa  69.7  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0997  adaptor protein  25.94 
 
 
239 aa  66.6  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0891253  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1016  adaptor protein  25.94 
 
 
239 aa  66.6  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000556878  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0568  adaptor protein  23.32 
 
 
223 aa  62.4  0.000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0578  adaptor protein  22.03 
 
 
240 aa  57.4  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.210236  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3752  negative regulator of genetic competence sporulation and motility-like protein  31.52 
 
 
261 aa  56.6  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000704019  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1976  negative regulator of genetic competence, sporulation and motility  24.36 
 
 
233 aa  50.4  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.724291  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1703  adaptor protein  21.1 
 
 
235 aa  47.4  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.732057  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1358  adaptor protein  20.55 
 
 
217 aa  42  0.006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00058732  normal  0.0135974 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>