41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0568 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0568  adaptor protein  100 
 
 		 223 aa  455  1e-127  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1703  adaptor protein  40.08 
 
 		 235 aa  158  7e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.732057  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1358  adaptor protein  41.41 
 
 		 217 aa  143  2e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00058732  normal  0.0135974 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1162  negative regulator of genetic competence, sporulation and motility  35.48 
 
 		 241 aa  91.7  9e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1620  adaptor protein  25.43 
 
 		 226 aa  85.9  4e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0578  adaptor protein  25.85 
 
 		 240 aa  84.3  0.000000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.210236  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0765  adaptor protein  25.53 
 
 		 228 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1244  adaptor protein  25.76 
 
 		 227 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0906  adaptor protein  23.71 
 
 		 224 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1311  adaptor protein  25.33 
 
 		 227 aa  79.7  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.425461  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1349  adaptor protein  25.33 
 
 		 227 aa  79.7  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.281114  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1111  adaptor protein  25.33 
 
 		 227 aa  79.7  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1087  adaptor protein  25.33 
 
 		 227 aa  79.7  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.730074  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1273  adaptor protein  25.33 
 
 		 227 aa  79.3  0.00000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1093  adaptor protein  25.33 
 
 		 227 aa  79.3  0.00000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4097  adaptor protein  25.33 
 
 		 227 aa  79  0.00000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1099  adaptor protein  24.45 
 
 		 227 aa  77  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0997  adaptor protein  24.58 
 
 		 239 aa  77  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0891253  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1016  adaptor protein  24.58 
 
 		 239 aa  77  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000556878  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1976  negative regulator of genetic competence, sporulation and motility  23.4 
 
 		 233 aa  75.5  0.0000000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.724291  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0216  adaptor protein  23.69 
 
 		 249 aa  74.7  0.000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0139  adaptor protein  23.79 
 
 		 251 aa  72.8  0.000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1213  adaptor protein  23.66 
 
 		 200 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000472996  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2566  Negative regulator of genetic competence  28 
 
 		 204 aa  67  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1203  adaptor protein  24.64 
 
 		 217 aa  67  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.10671  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1584  adaptor protein  24.11 
 
 		 202 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.3725299999999996e-31 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1510  adaptor protein  24.11 
 
 		 202 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000470165  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1616  adaptor protein  24.11 
 
 		 202 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000116418  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1651  adaptor protein  24.11 
 
 		 202 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000117003  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1400  adaptor protein  24.11 
 
 		 202 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0457533  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1372  adaptor protein  24.11 
 
 		 202 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000504302  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1371  adaptor protein  24.11 
 
 		 202 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000125272  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1545  adaptor protein  23.01 
 
 		 202 aa  65.9  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00170142  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1412  adaptor protein  23.45 
 
 		 202 aa  63.5  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000280861  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3800  adaptor protein  22.57 
 
 		 202 aa  62.4  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000607064  hitchhiker  0.000000000000878856 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0444  adaptor protein  23.32 
 
 		 196 aa  62.4  0.000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2184  adaptor protein  23.56 
 
 		 196 aa  60.8  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0186536  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0085  negative regulator of genetic competence  25.33 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4102  Negative regulator of genetic competence  23.91 
 
 		 193 aa  58.2  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000186936  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1712  Negative regulator of genetic competence  21.68 
 
 		 204 aa  54.7  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.103848  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0564  negative regulator of genetic competence sporulation and motility-like protein  23.02 
 
 		 265 aa  46.2  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>