37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2566 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_2566  Negative regulator of genetic competence  100 
 
 
204 aa  417  1e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0085  negative regulator of genetic competence  54.33 
 
 
210 aa  243  9.999999999999999e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4102  Negative regulator of genetic competence  29.95 
 
 
193 aa  96.3  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000186936  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3752  negative regulator of genetic competence sporulation and motility-like protein  27.03 
 
 
261 aa  80.5  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000704019  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1712  Negative regulator of genetic competence  28.77 
 
 
204 aa  79  0.00000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.103848  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1213  adaptor protein  28.57 
 
 
200 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000472996  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3800  adaptor protein  27.75 
 
 
202 aa  75.5  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000607064  hitchhiker  0.000000000000878856 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1545  adaptor protein  27.75 
 
 
202 aa  75.1  0.0000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00170142  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1510  adaptor protein  27.75 
 
 
202 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000470165  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1372  adaptor protein  27.75 
 
 
202 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000504302  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1584  adaptor protein  27.75 
 
 
202 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.3725299999999996e-31 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1400  adaptor protein  27.75 
 
 
202 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0457533  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1616  adaptor protein  27.75 
 
 
202 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000116418  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1651  adaptor protein  27.75 
 
 
202 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000117003  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1371  adaptor protein  27.75 
 
 
202 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000125272  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2184  adaptor protein  26.47 
 
 
196 aa  72  0.000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0186536  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1412  adaptor protein  26.79 
 
 
202 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000280861  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0444  adaptor protein  25.85 
 
 
196 aa  69.7  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0568  adaptor protein  28 
 
 
223 aa  67  0.0000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0765  adaptor protein  27.35 
 
 
228 aa  60.8  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1620  adaptor protein  25.33 
 
 
226 aa  60.5  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1358  adaptor protein  25.9 
 
 
217 aa  57.4  0.0000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00058732  normal  0.0135974 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1703  adaptor protein  24.47 
 
 
235 aa  57  0.0000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.732057  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1016  adaptor protein  26.78 
 
 
239 aa  53.1  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000556878  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0997  adaptor protein  26.78 
 
 
239 aa  53.1  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0891253  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1162  negative regulator of genetic competence, sporulation and motility  27.71 
 
 
241 aa  50.1  0.00002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0578  adaptor protein  26.12 
 
 
240 aa  49.3  0.00004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.210236  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0906  adaptor protein  23.79 
 
 
224 aa  47  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1349  adaptor protein  33.33 
 
 
227 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.281114  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1244  adaptor protein  33.33 
 
 
227 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4097  adaptor protein  33.33 
 
 
227 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1273  adaptor protein  33.33 
 
 
227 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1087  adaptor protein  33.33 
 
 
227 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.730074  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1093  adaptor protein  33.33 
 
 
227 aa  43.1  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1111  adaptor protein  33.33 
 
 
227 aa  43.1  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1311  adaptor protein  33.33 
 
 
227 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.425461  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1099  adaptor protein  33.33 
 
 
227 aa  42.7  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>