55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0010 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_0010  Mg2+ and Co2+ transporter  100 
 
 
228 aa  468  1.0000000000000001e-131  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000139051  hitchhiker  0.00000000019085 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0156  transporter  26.61 
 
 
311 aa  85.1  9e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1071  Mg2+ and Co2+ transporter  27.69 
 
 
301 aa  82  0.000000000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1826  Mg2+ and Co2+ transporter-like protein  24.88 
 
 
305 aa  80.5  0.00000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0715  transporter  25.35 
 
 
306 aa  80.1  0.00000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0409266 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1574  cationic transporter  24.88 
 
 
274 aa  79  0.00000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0474991  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1881  Mg2 transporter protein CorA family protein  25.23 
 
 
312 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000406477  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2215  Mg2+ transporter protein, CorA-like protein  24.88 
 
 
315 aa  77  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00295785  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1527  Mg2+ and Co2+ transporter  26.13 
 
 
302 aa  77.4  0.0000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00743319  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2083  magnesium transporter, CorA family  23.36 
 
 
313 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2151  magnesium transporter, CorA family  23.36 
 
 
313 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0239499  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2040  magnesium transporter, CorA family  23.36 
 
 
313 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0746182  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3269  magnesium transporter, CorA family  23.36 
 
 
313 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.639337  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2050  magnesium transporter cora family protein  23.36 
 
 
313 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.313249  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1866  magnesium and cobalt transport protein  23.36 
 
 
313 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000280155  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1903  magnesium transporter CorA family protein  23.36 
 
 
313 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00149373  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0875  magnesium transporter CorA family protein  27.78 
 
 
305 aa  74.3  0.000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00265274  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2406  Mg2 transporter protein CorA family protein  25.23 
 
 
312 aa  73.9  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1900  Mg2 transporter protein CorA family protein  23.36 
 
 
313 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000765251  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1539  Mg2 transporter protein CorA family protein  22.43 
 
 
313 aa  72.8  0.000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000914298  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1856  magnesium and cobalt transport protein  22.9 
 
 
313 aa  72.4  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000963836  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2119  magnesium transporter CorA family protein  22.9 
 
 
295 aa  72.4  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.153353  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1715  hypothetical protein  24.88 
 
 
314 aa  71.2  0.00000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.014259  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1967  CorA family protein  23.53 
 
 
315 aa  66.6  0.0000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00999125  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1055  Mg2 transporter protein CorA family protein  25.23 
 
 
310 aa  64.3  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4695  Mg2 transporter protein CorA family protein  23.5 
 
 
312 aa  63.9  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.551554  normal  0.0119033 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2252  Mg2 transporter protein CorA family protein  27.95 
 
 
310 aa  63.5  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000868965  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1711  magnesium transporter CorA family protein  21.96 
 
 
314 aa  62  0.000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000354996  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3146  Mg2 transporter protein CorA family protein  23.36 
 
 
311 aa  61.6  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.896486  normal  0.696922 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0663  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  21.96 
 
 
310 aa  61.6  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0027  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  26.62 
 
 
308 aa  60.5  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.905993  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0484  Mg2 transporter protein CorA family protein  22.97 
 
 
314 aa  60.1  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1185  Mg2 transporter protein CorA family protein  25.23 
 
 
308 aa  60.1  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2662  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  25.46 
 
 
312 aa  59.7  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2402  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  23.76 
 
 
314 aa  58.5  0.00000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0013956  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06390  Mg2+/Co2+ transporter  22.83 
 
 
319 aa  58.5  0.00000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.139821  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2448  Mg2 transporter protein CorA family protein  23.76 
 
 
314 aa  58.5  0.00000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000474618  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2452  magnesium and cobalt transporter  25.7 
 
 
314 aa  58.2  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.920957  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2767  putative cation transporter  25.7 
 
 
314 aa  58.2  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0994122  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2001  Mg2 transporter protein CorA family protein  24.07 
 
 
310 aa  57.8  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000539892  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2925  Mg2+ transporter protein, CorA-like  25.58 
 
 
310 aa  57.8  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00031498  normal  0.189156 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1723  Mg2+ and Co2+ transporter  21.4 
 
 
314 aa  57.4  0.0000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00210024  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2060  Mg2+ and Co2+ transporter  23.18 
 
 
307 aa  57  0.0000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3494  Mg2 transporter protein CorA family protein  23.39 
 
 
316 aa  57  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000281654  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0242  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  23 
 
 
308 aa  56.6  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.291265  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11050  Mg2+/Co2+ transporter  20.91 
 
 
323 aa  55.8  0.0000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0387037  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2211  Mg2+ transporter protein, CorA-like protein  22.69 
 
 
310 aa  53.5  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0326  Mg2+ and Co2+ transporter  23.49 
 
 
316 aa  52.8  0.000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2823  Mg2 transporter protein CorA family protein  23.91 
 
 
313 aa  52.4  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.714315  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3219  magnesium and cobalt transport protein, putative  23.91 
 
 
313 aa  52.4  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0019  Mg2 transporter protein CorA family protein  37.18 
 
 
303 aa  52.4  0.000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0447  magnesium transporter CorA family protein  25.35 
 
 
287 aa  49.3  0.00005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0266087  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0170  Mg2+ and Co2+ transporter  23.39 
 
 
304 aa  48.9  0.00006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0023  Mg2 transporter protein CorA family protein  27.85 
 
 
310 aa  43.9  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1657  Mg2+ transporter protein, CorA-like  28.89 
 
 
344 aa  43.5  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.180392 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>