26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3819 on replicon NC_013744
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013744  Htur_3819  hypothetical protein  100 
 
 
386 aa  776    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0720248  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3802  Lipoate-protein ligase A-like protein  34.27 
 
 
378 aa  169  5e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0279877  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2034  biotin/lipoate A/B protein ligase  26.21 
 
 
366 aa  69.7  0.00000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0443  biotin/lipoate A/B protein ligase  22.77 
 
 
530 aa  63.9  0.000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2218  biotin/lipoate A/B protein ligase  24.3 
 
 
349 aa  63.9  0.000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2128  biotin/lipoate A/B protein ligase  23.9 
 
 
372 aa  57  0.0000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0607832  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11650  lipoate-protein ligase A  25.49 
 
 
352 aa  56.6  0.0000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1428  biotin/lipoate A/B protein ligase  25.12 
 
 
354 aa  55.5  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1560  biotin/lipoate A/B protein ligase  24.41 
 
 
344 aa  55.5  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0396798 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2206  biotin/lipoate A/B protein ligase  23.64 
 
 
360 aa  54.7  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.46351  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0980  lipoate-protein ligase A  27.14 
 
 
253 aa  54.7  0.000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1879  biotin/lipoate A/B protein ligase  24.3 
 
 
365 aa  54.7  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00459014 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4031  biotin/lipoate A/B protein ligase  25.5 
 
 
349 aa  53.9  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0965  Lipoate--protein ligase  24.87 
 
 
257 aa  50.4  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.119458  normal  0.259111 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1480  lipoate-protein ligase  21.78 
 
 
364 aa  49.7  0.00008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.521497  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0642  Lipoate--protein ligase  23 
 
 
363 aa  49.7  0.00009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.336498  normal  0.0925855 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1514  biotin/lipoate A/B protein ligase  24.11 
 
 
261 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0104687 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0931  biotin/lipoate A/B protein ligase  22.47 
 
 
343 aa  48.9  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000248179  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2379  biotin/lipoate A/B protein ligase  23.23 
 
 
358 aa  48.1  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3413  biotin/lipoate A/B protein ligase  22.31 
 
 
261 aa  46.2  0.0009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0322711  normal  0.107721 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1106  Lipoate--protein ligase  23.26 
 
 
245 aa  45.4  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000000000820504  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2086  biotin/lipoate A/B protein ligase  21.55 
 
 
344 aa  45.1  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10810  lipoate-protein ligase A  21.51 
 
 
349 aa  44.7  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0653511  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09720  lipoate-protein ligase A  22.22 
 
 
364 aa  44.3  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.331543  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1701  biotin/lipoate A/B protein ligase  22.71 
 
 
349 aa  43.1  0.008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.407225  normal  0.0224551 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1213  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  21.8 
 
 
329 aa  42.7  0.01  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>